换一批利用简化基因组技术分析甘薯种间单核苷酸多态性
Analysis of Interspecific SNPs in Sweetpotato Using a Reduced-Representation Genotyping Technology
摘要选用Xushu 18(6x)和Nancy Hall(6x)、2个二倍体Ⅰ.trifida(2x)品系(4597-10和4597-21)、四倍体Ⅰ.trifida(4x)、六倍体I.trifida(6x)、二倍体Ⅰ.temussima(2x)和Ⅰ.littorallis(2x)以简化基因组测序技术SLAF-seq测序,获得724589个SLAF标签,其中多态性SLAF标签35310个.通过序列分析,获得40765个有效单核苷酸多态(SNP),并用这些SNP分析了8个种质的群体结构和系统发生树.结果表明,利用简化基因组测序技术SLAF-seq能高效、低成本地开发出大量可用于群体遗传分析的SNP标记;通过构建进化树发现甘薯栽培种和野生种Ⅰ.trifida的亲缘关系比较近.这些分析结果为进一步研究甘薯栽培种的起源提供了基础数据.
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DOI
10.3724/SP.J.1006.2016.00641
发布时间
2016-05-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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