换一批不同种植方式大豆根际土壤细菌多样性分析
Bacterial Diversity of Soybean Rhizosphere Soil under Different Cropping Patterns
摘要利用Illumina MiSeq第二代高通量测序平台,对黑龙江省不同地区轮作及连作大豆根际土壤细菌16S rDNA基因组测序,初步分析在不同种植方式下受大豆胞囊线虫侵染的大豆根际土壤细菌群落结构的变化.从6个土壤样本中共获得25419个OTUs,鉴定到细菌的47个门,147个纲,709个属.变形菌门、放线菌门、酸杆菌门、芽单胞菌门、浮霉菌门是供试土壤细菌的优势菌门,占所有细菌群落总数90％以上.连作4年总OTUs及丰富度最高,连作20年最低.不同轮作方式土壤细菌丰富度差异不显著(P>0.05),短期连作与长期连作细菌丰富度及多样性差异显著(P<0.05).不同轮作方式下放线菌门相对丰度低于连作方式,芽单胞菌门和拟杆菌门相对丰度高于同地区连作方式.土壤功能细菌根瘤菌(Bradyrhizobium)、链霉菌属(Streptomyces)、芽孢杆菌属(Bacillus)、溶杆菌属(Lysobacter)、土微菌属(Pedomicrobium)的相对丰度在不同年限连作下高于轮作.长期连作土壤优势细菌丰度与轮作土壤相似性更高.
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