换一批结球白菜和拟南芥防御素基因的鉴定与比较分析
Genome-wide identification and comparative analysis of defensin genes from Chinese cabbage and Arabidopsis thaliana
摘要植物防御素是一类富含半胱氨酸的小分子蛋白,在抗病反应中起着重要作用.本研究以结球白菜和拟南芥基因组序列为材料,利用生物信息学手段进行基因鉴定、染色体定位和进化分析.结果表明,结球白菜有11个防御素基因成员,数量少于拟南芥(15个),基因组DNA全长183 ～637 bp,开放阅读框全长183～363 bp;除结球白菜Bra029208序列外,其余防御素基因均有1个内含子;基因定位结果表明,一些基因成簇分布,推测由串联重复所致,拟南芥的3号、结球白菜的1、4、5和10号染色体均没有防御素基因的分布;进化分析结果表明,26个防御素成员可分为三大类,Ⅰ类有10条序列,Ⅱ类13条,Ⅲ类最少,仅3条.
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关键词
结球白菜防御素基因序列分析染色体定位进化分析Chinese cabbagedefensin genesequence analysischromosomal locationevolution analysis
分类号
S436.3
栏目名称
发布时间
2013-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
浙江省公益性技术应用研究计划（2012C32011）
台州市科技计划（121KY16）
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