基于生物信息学分析CD59在胰腺癌中的表达及预后影响

Expression and prognosis of CD59 in pancreatic cancer based on bioinformatics analysis

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摘要目的通过生物信息学方法分析 CD59 在胰腺癌中的表达及预后意义.方法利用基因表达谱交互分析 2(gene expression profiling interactive analysis 2,GEPIA2)和人类蛋白组图谱(human protein atlas,HPA)数据库比较CD59 在胰腺癌组织与癌旁组织中的表达差异;利用卡普兰麦尔(Kaplan-Meier plotter)数据库评价CD59 表达水平对患者预后的影响;利用String和Cytoscape3.9.1 软件分析CD59 蛋白互作网络;利用DAVID6.8 对CD59 及关键的互作基因进行基因富集和通路富集分析.结果与正常组织相比,CD59 在胰腺癌组织中的表达显著上调(P<0.05),CD59 高表达患者的总体生存时间(HR=2.3,95%CI:1.52～3.50)和无复发生存时间(HR=4.31,95%CI:1.57～11.83)较CD59 低表达患者短.蛋白互作网络分析揭示CD59 与CD55、GOLGA2、LMAN1、TMED2 和SERPINA1 等多个分子关系密切.基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析表明CD59主要参与补体激活、先天免疫反应和冠状病毒-COVID-19 等通路.结论 CD59 在胰腺癌组织中高表达,受免疫相关基因的影响,且与患者预后较差相关,可作为胰腺癌早期诊断及预测预后的标志物之一.