换一批彩叶草中一个富亮氨酸重复相关蛋白基因SsLRP的克隆和分析
Molecular Cloning and Analysis of a Novel Leucine-Rich Repeat Related Protein Gene,SsLRP,from Solenostemon scutellarioides(L) Codd
摘要根据彩叶草叶片小型EST库中一条具有1个富亮氨酸重复(leucine-rich repeat,LRR)结构域的EST序列,采用RACE与文库结合的方法,克隆了1个具有5个LRR结构域的全长cDNA,SsLRP(LRR-Related Protein)(GenBank登录号FJ787729).SsLRPcDNA全长1 024 bp,包含一个657 bp的ORF框,编码218个氨基酸.其5'-UTR区含有2个终止子TAG,3'-UTR区具有推测的加尾信号AATAAA,SsLRP蛋白N端具有的信号肽和保守的亮氨酸拉链结构域,具有5个保守的LRR结构域,多个磷酸化位点和N-糖基化位点.多序列比对和系统进化分析表明,SsLRP与番茄S1LRP同源性最高.二级结构和三级结构预测表明,SsLRP的功能可能与保守的LRR结构域密切相关,推测该基因可能参与蛋白间的相互作用与信号识别.RTPCR分析表明,SsLRP与番茄SILRP具有相似的表达模式,在正常植株的根、茎、叶和花中都有表达,在受菌核病感染植株的茎和叶中表达上调.
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