藜麦生长素结合蛋白基因ABP1的鉴定与表达分析

Identification and characterisation of auxin-binding protein gene ABP1 in Chenopodium quinoa

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摘要生长素结合蛋白ABP1已被证实具有生长素受体功能.以拟南芥(Arabidopsis thaliana)的ABP1为基础,通过BLAST筛选藜麦的ABP1基因、蛋白质序列,并结合生物信息学方法对其理化性质以及亚细胞定位、二级和三级结构、蛋白序列的motif及domain、系统进化树、启动子顺式作用元件进行了分析.结果显示:藜麦基因组有2个编码ABP1基因CqABP1.7g和CqABP1.17g,位于Chr07和Chr17,等电点为6.03到6.35,蛋白质中脂肪族侧链氨基酸含量的相对值为90.88％到96.22％,且亚细胞定位在细胞质、内质网上;二级结构以延伸链、无规则卷曲和a-螺旋为主.藜麦的ABP1与甜菜的同源关系更近,在进化上出现了单双子叶的分化.CqABP1.17g在藜麦花中高水平表达,而CqABP1.7g在籽粒发育过程高水平表达;在CqABP1.17g中发现多个插入缺失(INDEL)变异,CqABP1.7g中只发现1个INDE1变异,未检测到移码突变;预测的互作蛋白有生长素外排载体、鸟嘌呤核苷酸交换因子SPIKE1、含CRIB结构域的蛋白等.该研究结果为进一步探讨CqABP1s基因功能,调控藜麦生长发育提供一定的理论基础与试验依据.