基于BSA-Seq筛选鲜食糯玉米抗南方锈病候选基因
Screening candidate genes for resistance to southern corn rust in fresh waxy maize based on BSA-Seq
摘要玉米南方锈病(southern corn rust,SCR)是影响华南地区鲜食玉米生产的主要病害之一,筛选抗南方锈病相关基因对鲜食糯玉米(Zea mays var.sinensis)抗病品种的选育和遗传改良具有重要作用.本研究以鲜食糯玉米高抗南方锈病自交系09N1-1-1和高感病自交系09N9-3为亲本进行杂交,构建F2代分离群体.从F2代群体中挑选高抗和高感南方锈病的单株各30株,分别构建极端性状的DNA混池,通过混合群体分离测序(bulked-segregant analysis sequencing,BSA-Seq)技术初步定位鲜食糯玉米抗南方锈病相关基因.结果表明,测序平均覆盖深度为33.50x,得到1个与抗病相关的候选区域,长度为4.23 Mb,位于玉米10号染色体上,共包含150个基因.其中,有119个基因存在非同义突变,53个基因存在移码突变.对候选区域内基因进行注释分析,定位到7个与抗病相关的候选基因:Zm00001d023332、Zm00001d023265、Zm00001d023267、Zm00001d023304、Zm00001d023303、Zm00001d023393和Zm00001d023273.研究结果可为鲜食糯玉米南方锈病抗病基因的克隆及抗病新品种选育提供参考依据.
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