换一批
换一批摘要详细了解蛋白质的三级结构信息有助于理解其生物学功能.随着植物基因组研究的进展,已发现了50多个植物类金属硫蛋白(Metallothionein-Like, MT-L)基因.但至今只有少数几个MT-L蛋白得到了纯化,而其结构尚无报道,因此有必要建立分析这类蛋白结构特征的方法.本研究根据已知的哺乳动物MT的结构数据,分析得出了CXC、CXXC模式和金属-硫络合簇结构原子间的距离限制条件,并用距离几何算法计算得出预测蛋白可能的构象;然后通过统计分析筛选出目标函数值显著较小、构象能低的结构作为这些蛋白半胱氨酸富含区的预测结构,由此建成了适合于植物类金属硫蛋白半胱氨酸富含区的结构预测方法.从应用该方法正确地预测出了已知结构的蓝蟹MT的结构来看,该方法是可行的.并用该方法预测了油菜MT-L蛋白的半胱氨酸富含区的结构.
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关键词
植物类金属硫蛋白半胱氨酸富含区三级结构预测距离几何算法plant metallothionein-like proteincysteine rich domaintertiary structure predictiondistance geometry algorithm
分类号
Q945
栏目名称
研究论文
DOI
10.3321/j.issn:1672-9072.2002.10.005
发布时间
2005-11-03
基金项目
国家高技术研究发展计划(863计划)
教育部霍英东教育基金会高等院校青年教师基金
教育部跨世纪优秀人才培养计划
国家重点基础研究发展计划(973计划)
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