换一批同域分布的3种木蓼属植物叶绿体基因组比较
Comparative Analyses on the Chloroplast Genome of Three Sympatric Atraphaxis Species
摘要刺木蓼(Atraphaxis spinosa)、额河木蓼(A.jrtyschensis)和细枝木蓼(A.decipiens)是同域分布在我国新疆北部的3种木蓼属物种.通过二代高通量测序,对叶绿体基因组进行组装和注释,比较3个物种的叶绿体基因组差异并进行系统发育分析.结果表明,木蓼属3个物种的叶绿体全基因组大小为164 106-164 216 bp,与其它绿色植物类似,由1个大单拷贝区(LSC)、1个小单拷贝区(SSC)及介于二者之间的2个反向重复区(IRa/IRb)组成.在刺木蓼、额河木蓼和细枝木蓼中检测到48-49个串联重复序列及59-63个简单重复序列(SSR).3个物种的核苷酸多样性平均值为0.000 96,Ka/Ks平均值为0.030 3,遗传距离平均值为0.001 0.通过对3个物种的叶绿体基因组进行比较,发现编码区比非编码区更保守.系统发育分析结果显示3个物种的亲缘关系较近.该研究基于叶绿体基因组对木蓼属物种的亲缘关系进行分析,揭示了3个同域分布的物种之间的亲缘关系以及木蓼属在蓼科中的系统位置.研究结果可为木蓼属的分类学、系统学和生物地理学研究提供参考.
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关键词
叶绿体基因组木蓼属同域分布比较基因组学系统发育chloroplast genomeAtraphaxissympatric distributioncomparative genomicsphylogeny
栏目名称
DOI
10.11983/CBB22065
发布时间
2023-08-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（No.31760102）
新疆维吾尔自治区重点实验室开放课题（No.2020D04033）
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