大豆TPS基因家族在盐胁迫下的表达变化及单倍型选择规律分析
Changes in the Expression of the Soybean TPS Gene Family Under Salt Stress and Haplotype Selection Analysis
摘要海藻糖-6-磷酸合酶(trehalose-6-phosphate synthase,TPS)是合成海藻糖的关键酶,已在多个物种中被报道参与调节光合作用、糖代谢、生长发育和逆境响应等生理过程.目前,TPS在大豆(Glycine max)中的报道极少.该文在大豆全基因组中鉴定了20个TPS基因及其包含的10种重要蛋白保守基序.启动子元件分析显示,大豆TPS基因的启动子区富含大量胁迫响应元件;盐胁迫处理后,17个TPS基因的表达发生变化,其中12个基因上调表达,5个基因下调表达.对TPS进行单倍型和选择趋势分析,发现TPS8、TPS13、TPS15、TPS17和TPS18存在2种主要的等位变异,其中携带TPS15H2、TPS13H2、TPS17H2和TPS18H2的品种在栽培品种中大量富集,受到强烈的人工选择.该研究揭示了大豆TPS基因家族的分子特征以及在盐胁迫下的表达模式和进化历史,旨在为进一步解析大豆TPS基因的功能以及培育耐盐大豆品种提供理论依据和遗传材料.
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