换一批沙冬青AmLEA5基因的生物信息学分析及非生物胁迫下的表达模式
Bioinformatic Analysis and Expression Patterns under Abiotic Stresses of AmLEA5 from Ammopiptanthus mongolicus
摘要对用固相扣除杂交方法从低温驯化沙冬青克隆得到的AmLEA5基因进行表达模式分析和生物信息学分析,表明该基因编码一种第5族胚胎发育晚期丰富蛋白(LEA),全长693 bp,含有1个297 bp的开放阅读框,编码98个氨基酸,预测Am-LEA5的分子量为10.6 kDa,是一种亲水性蛋白,有多个磷酸化位点.密码子偏好性分析表明该基因略偏好于用A或T结尾的密码子.系统发生分析表明,AmLEA5蛋白与蒺藜苜蓿LEA(ACJ84182.1)亲缘关系最近.qRT-PCR结果显示AmLEA5的表达量在低温、干旱、盐和热胁迫条件下均有上调,尤其在低温胁迫后期富集量最高.亚细胞定位表明,用YFP标记的AmLEA5位于细胞质和细胞核内.一系列试验结果表明AmLEA5基因在沙冬青抵御非生物胁迫,尤其是在抵御低温胁迫机制中发挥重要作用.
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