换一批一个特异水稻原纤蛋白FBN11的生物信息学和基因表达特性分析
Bioinformatics and Expression Analysis of a Specific Fibrillin Gene FBN11 in Rice
摘要Fibrillin 11(FBN 11)是植物质体中FBN蛋白家族的重要成员之一,比其他成员多300～500个氨基酸残基,说明其可能存在某些特异性结构和功能.本研究在水稻幼苗中扩增获得到了一个受非生物逆境胁迫诱导的OsFBN11基因的全长cDNA,该基因含有12个内含子和13个外显子.其编码蛋白的分子量为72.36 kD,pI值为9.26.生物信息学分析结果表明,该蛋白含有无规则卷曲、α螺旋和β-折叠3种氨基酸二级结构,不合有跨膜结构域,蛋白亲水性强,PSORT软件预测该蛋白可能定位于叶绿体中.进一步对14种植物FBN11蛋白的同源性和5个物种该蛋白的保守结构域分析,发现该蛋白兼有典型的PAP-Fibrillin结构域和蛋白激酶PKc结构域.水稻全生育期芯片分析显示该基因主要在愈伤组织、叶片和根系中高水平表达.RT-PCR检测结果显示,该基因在水稻幼苗中受ABA、NaC1和干旱胁迫处理上调表达.上述结果表明,OsFBN11可能在水稻质体发育和抗非生物胁迫反应中发挥重要作用.
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关键词
水稻Fibrillin基因家族水稻FBN11基因生物信息学分析逆转录-聚合酶链式反应rice Fibrillin gene family OsFBN11 bioinformatics analysis RT-PCR
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DOI
10.13430/j.cnki.jpgr.2014.03.030
发布时间
2014-06-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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