换一批内蒙古糜黍资源DNA分子身份证的构建
Construction of DNA Molecular Identity Card of Broomcorn Millet Resources in Inner Mongolia
摘要糜黍(Panicum miliaceum L.)是一种品种资源多样的古老作物,采用荧光SSR标记,对糜黍资源进行数字化的管理与分类,可将众多资源合理高效应用.本研究以258份内蒙古糜黍资源为材料,基于本课题组前期开发的85个常规SSR标记,经多次扩增筛选、优化、加工(引物5'端添加荧光基团)获得12个荧光SSR核心标记.利用MapChart 2.32绘制标记的染色体定位图,利用ID Analysis 4.0检测标记对材料的区分度,用PowerMarker 3.25和PopGen 1.32进行遗传多样性分析,用MEGA 11.0.10和NTSYSpc2.11a分别绘制聚类图和主成分分析图,最终应用草料二维码生成器构建材料的DNA分子身份证.遗传多样性分析发现,利用7个标记扩增258份材料,共有123个等位基因,平均每个标记有17.5714个;有效等位基因数、Shannon多样性指数、观测杂合度、期望观测杂合度、Nei's基因多样性指数和多态性信息含量均值分别为7.4622、2.2270、0.8021、0.8372、0.8353和0.8994.将毛细管电泳结果以特定方式进行编码处理,最终仅用7个荧光标记(RYW6、RYW8、RYW37、RYW40、RYW67、RYW124和RYW125)组合在一起生成全部材料的字符串和二维码DNA分子身份证,为内蒙古糜黍种质资源的分类管理及快速鉴定提供了分子检测工具和理论依据.
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关键词
糜黍内蒙古荧光SSR标记毛细管电泳分子身份证broomcorn milletInner Mongoliafluorescent SSR markerscapillary electrophoresismolecular identity card
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DOI
10.13430/j.cnki.jpgr.20240403002
发布时间
2025-02-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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