换一批甘薯PAL基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析
Genome-wide Identification and Bioinformatics Analysis of the PAL Gene Family in Sweetpotato[Ipomoea batatas(L.)Lam.]
摘要苯丙氨酸解氨酶(PAL,phenylalanin ammonia-lyase)是苯丙烷代谢途径中的关键酶和限速酶,在植物生长发育、抗逆等方面发挥重要作用.本研究在甘薯全基因组中筛选PAL基因家族成员,对甘薯PAL基因家族成员的理化性质、系统进化、保守结构域、染色体定位及基因表达进行了分析.结果表明:在甘薯全基因组中共鉴定出33个PAL成员,不均匀地分布于2、6、9和15号染色体上,PAL蛋白理化性质差异小,保守基序和基因结构相近.IbPAL启动子上存在多个逆境胁迫应答、激素响应和生长发育调控相关的顺式作用元件.甘薯IbPAL与拟南芥、三浅裂野牵牛和三裂叶薯PAL基因存在共线性关系.甘薯转录组数据显示,IbPAL基因在甘薯中的表达存在组织特异性,IbPAL19、IbPAL13、IbPAL7在储藏根的表达量明显高于未分化根和须根.qRT-PCR结果显示IbPAL基因受到干旱和盐胁迫的诱导,在不同胁迫处理下表达模式不同.本研究为进一步探明甘薯PAL家族基因的功能提供了参考,为甘薯遗传改良奠定了基础.
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关键词
甘薯PAL基因家族全基因组鉴定生物信息学分析sweetpotatoPAL gene familycomplete genome identificationbioinformatics analysis
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DOI
10.13430/j.cnki.jpgr.20240626003
发布时间
2025-07-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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