基于BSA-seq和GWAS技术的豇豆花色基因定位分析
Localisation Analysis of Cowpea Flower Color Genes Based on BSA-seq and GWAS Techniques
摘要豇豆(Vigna unguiculata)是主要豆科农作物之一,广泛分布在全球热带和亚热带地区,我国各地均有种植.豇豆花色是一种重要农艺性状,在其繁殖过程中发挥着重要作用,但是豇豆花色变异的分子遗传基础尚不清楚.为此,采用基于重组自交系群体花色的BSA-seq分析与豇豆自然群体(271份)花色的全基因组关联分析相结合,将控制花色的基因定位于第9号染色体上31.9 Mb~32.3 Mb之间(0.4 Mb).分析表明该区间包含30个基因,其中TRANSPARENT TESTA GLABRA 1(TTG1)基因位于SNP-index峰值附近,且在拟南芥中参与调控花青素的生物合成.进一步采用RT-qPCR分析发现,紫色和白色旗瓣的TTG1基因表达量存在显著差异.此外,在该区域内筛选出2对多态性SSR引物,能够区分RILs群体中紫色和白色旗瓣个体.本研究结果可为豇豆花色遗传变异和分子育种提供一定的理论依据.
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