水稻肽酶M24蛋白家族鉴定及盐碱胁迫表达分析
Genome Identification of Metallopeptidase Family 24 in Rice and Their Expression Analysis under Saline-alkaline Stress
摘要肽酶M24蛋白(M24,Metallopeptidase 24)是一类含有"皮塔面包"保守结构域的蛋白,广泛存在于动物、植物及微生物中,在个体发育、器官建成及逆境胁迫应答等方面发挥重要作用.本研究对水稻肽酶M24家族成员进行鉴定和生物信息学分析,并利用qRT-PCR手段探究其对盐碱胁迫的响应.结果表明,在水稻全基因组中共鉴定出16个OsM24成员,不均匀地分布在12条染色体中的9条上,OsM24成员之间在氨基酸数目、蛋白稳定性及疏水性等基本理化性质方面差异显著.系统进化分析发现OsM24家族分为OsM24Ⅰ、OsM24Ⅱ和OsM24Ⅲ三个亚族,同一亚族成员的基因结构、保守基序和结构域相对保守.GO和相互作用蛋白分析推测OsM24家族成员依赖其水解活性在蛋白质合成、加工和修饰等方面发挥作用.顺式作用元件分析表明OsM24家族基因的启动子区存在多种植物激素、非生物胁迫及生长发育相关响应元件.表达模式分析表明OsM24家族成员在水稻不同组织中具有显著的表达特异性.qRT-PCR结果表明除OsM24-7、OsM24-12、OsM24-15和OsM24-16外,其余12个OsM24基因均能够响应盐碱胁迫,但在盐胁迫和碱胁迫下表达模式存在差异,这暗示OsM24可能通过不同调控途径应答盐碱胁迫.本研究为进一步理解肽酶M24蛋白在水稻生长发育和响应盐碱胁迫的功能提供理论参考.
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