换一批基于BSA-seq和RNA-seq挖掘西瓜抗蔓枯病候选基因
Mining Candidate Genes for Gummy Stem Blight Resistance by BSA-seq and RNA-seq in Watermelon(Citrullus lanatus)
摘要蔓枯病是危害西瓜生产的主要病害之一,发掘和利用抗蔓枯病基因对西瓜抗病种质创新及品种选育具有重要意义.本研究以蔓枯病抗病材料PI189225和感病材料K3为亲本构建的重组自交系(RIL)群体为材料,采用混池分组分析法(BSA,bulked segregant analysis)对亲本和抗感混池进行全基因组重测序,开展西瓜蔓枯病抗性基因定位研究,鉴定抗病基因的候选区域,同时结合转录组测序(RNA-seq)数据,挖掘西瓜抗蔓枯病候选基因.结果显示,基于BSA-seq分析在西瓜5号染色体和10号染色体上鉴定到与西瓜蔓枯病抗性显著关联的基因组区域,总长度为8.18Mb,包含681个基因.功能分析显示这些基因主要参与植物-病原体互作和苯丙烷类生物合成等代谢通路.进一步利用InDel标记和重组单株分析,将西瓜蔓枯病抗性区间缩小到10号染色体Chr10_30103333和Chr10_32554279标记之间,该区间大小为2.45 Mb.结合西瓜响应蔓枯病菌侵染的差异表达基因,在10号染色体上鉴定到6个候选基因.qRT-PCR结果表明,6个候选基因的表达均受到蔓枯病菌的诱导,Cla97C10G200140 和 Cla97C10G202140 在感病材料中高表达,Cla97C10G200100、Cla97C10G201690、Cla97C10G202570 和Cla97C10G201940在抗病材料中高表达.本研究结果为西瓜抗蔓枯病分子标记辅助选择及抗病品种选育提供重要的理论依据和基因资源.
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10.13430/j.cnki.jpgr.20250717001
发布时间
2026-02-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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