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基于SNP构建芋种质资源的分子身份证

Construction of Molecular ID in Taro Germplasm Using SNP Markers

摘要芋[Colocasia esculenta(L.)Schott]是世界第五大根茎类作物,其种质资源以地方品种为主.由于不同地区间引种频繁,以及长期依赖球茎进行无性繁殖,芋品种类型多且存在大量表型相似的材料,仅依赖表型性状鉴定已难以满足准确鉴别和高效管理的需求.为提升芋种质资源管理的精准度与数字化水平,基于前期重测序数据开发了覆盖全基因组的695对特异性引物.利用该引物体系对193份芋种质资源进行靶向测序,共检测到2317个高可信度SNP位点.基于遗传聚类分析,193份种质被清晰地划分为6个类群.计算样品间SNP差异位点所反映的遗传相似度,结果显示79.57%的样品对的遗传相似度集中在0.45~0.65区间;同时发现8对样品的遗传相似度高达0.98以上,可能为同物异名或遗传背景高度相近的材料.此外,还进一步筛选出17个核心SNP位点,构建了芋种质资源的分子指纹图谱,并结合其地理来源和品种类型信息,建立了每份材料唯一的分子身份证.本研究建立的方法体系为芋种质资源的精准区分、鉴定及基因型数据的数字化管理提供了有力的技术支撑,对种质资源的保护和高效利用具有重要的理论意义和应用价值.

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DOI 10.13430/j.cnki.jpgr.20251015001
发布时间 2026-03-13(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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植物遗传资源学报

植物遗传资源学报

2026年27卷2期

398-406页

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