换一批小偃麦衍生系抗旱相关指标的全基因组关联分析
Genome-wide Association Analysis of Drought Resistance Related Indicators in Wheat-Thinopyrum intermedium Introgression Line
摘要干旱是影响小麦产量的最主要非生物胁迫因素之一.为挖掘小偃麦衍生系中的重要抗旱位点及其候选基因,在前期萌发期抗旱鉴定的基础上,以180份小偃麦衍生系的15个抗旱相关指标,结合小麦55K SNP芯片基因分型,利用混合线性模型(PCA+K)进行全基因组关联分析,检测与抗旱指标显著关联的SNP位点,并对重要位点进行候选基因预测及单倍型分析.结果表明,15个抗旱相关指标均表现出广泛的表型变异,变异系数范围为4.22％～28.53％.相关分析表明15个抗旱相关指标之间大多存在显著或极显著相关性,频率分布均呈正态或偏正态分布.全基因组关联分析共检测到69个与抗旱指标显著关联的SNP位点,其中成簇分布的、多效性的和主效的SNP位点/区段有36个,分布在1A、1B、2A和2B等17条染色体上,表型贡献率为6.20％～12.00％.比较发现其中有11个是尚未见报道的抗旱性候选新位点.共筛选到125个与小麦抗旱相关的候选基因,编码晚期胚胎发生丰富蛋白、赖氨酸63特异性去泛素化酶、碱性亮氨酸拉链转录因子、快速碱化因子1、钙结合蛋白39、锌转运ATP酶、富含亮氨酸重复受体样蛋白激酶等蛋白.单倍型分析表明,21个候选基因不同单倍型间的抗旱表型差异显著,可能为重要抗旱候选基因.
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关键词
小偃麦衍生系萌发期抗旱性全基因组关联分析单倍型wheat-Thinopyrum intermedium introgression linegermination stagedrought resistanceGWAShaplotype
栏目名称
DOI
10.13430/j.cnki.jpgr.20260206002
发布时间
2026-07-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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