基于转录组测序的慈竹笋木质素基因筛选及其表达分析

Transcriptome-wide Identification of Lignin Gene Families of Bambusa emeiensis Shoots and Their Differential Expression

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摘要慈竹(Bambusa emeiensis)纤维素含量丰富,是较好的造纸原料,但竹茎中木质素影响着制浆生产及纸浆质量.目前,对慈竹木质素生物合成机制所知甚少,这限制了遗传调控竹木质素的研究.本文以拟南芥、水稻等植物的已知木质素基因作为查询序列,通过BLASTp和系统进化分析,从10、50、100和150 cm慈竹笋转录组数据中筛选到351个木质素生物合成相关Unigenes,包括51个LAC,37个4CL、26个PAL、34个CCR和25个CAD相关转录子,其数量高于其他已报道的竹类植物.转录丰度和定量基因表达分析发现16个木质素基因,包括2个PAL、5个CCR、3个4CL、2个CADH2和4个LAC,随着笋发育而表达上调,表明其可能与发育性木质素积累相关.

作者蒋海港 ^[1] 王树刚 ^[1] 刘阳 ^[1] 沈彦合 ^[1] 李祥宁 ^[1] 曹颖 ^[1] 学术成果认领

作者单位西南科技大学生命科学与工程学院,绵阳,621010 ^[1]

关键词慈竹笋木质素生物合成差异表达 Bambusa emeiensis bamboo shoots lignin biosynthesis differential expression

主题词基因(Genes)转录组(Transcriptome)植物(Plants)纤维素(Cellulose)遗传(Heredity)

分类号 S795.5

栏目名称 研究报告

DOI 10.7525/j.issn.1673-5102.2018.03.014

发布时间 2018-06-15

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