换一批84K杨4CL3/4CL5基因克隆及生物信息学分析
Cloning and Bioinformatics Analysis 4CL3/4CL5 Gene of Populus alba × P.glandulosa
摘要木质素是木材的重要组成成分,主要起机械支持、水分运输及防御病虫害等作用.4CL酶是控制木质素合成途径中的关键酶之一.利用PCR技术从84K杨幼叶cDNA中克隆得到Pag4CL3/4CL5基因,GenBank登录号分别为MK183033(Pag4CL3)及MK183034(Pag4CL5).利用生物信息学软件,对这两个基因的功能和特征进行分析.结果 发现84K杨中4CL3/4CL5蛋白与毛果杨中4CL3/4CL5蛋白相似度高达97％;此外,均含有SSGTTGLP-KGV和GEICIRG两个保守基序;亚细胞定位预测显示Pag4CL3/4CL5蛋白主要定位在内质网中,推测可能是一种膜蛋白;蛋白的亲水性预测Pag4CL3/4CL5均为亲水性蛋白.通过qRT-PCR分析Pag4CL3/4CL5在不同组织部位中的表达差异,结果发现Pag4CL3在叶及茎中表达量较高,在根和顶芽中表达量较低;Pag4CL5在叶及根中表达量较高,在茎和顶芽中表达量较低,两个同源基因表达具有组织部位的差异性.Pag4CL3和Pag4CL5可能在叶中共同行使功能,Pag4CL5主要在根中行使功能,Pag4CL3主要在茎中行使功能.
更多相关知识
- 浏览37
- 被引11
- 下载4
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
