换一批摘要空间转录组(spatial transcriptomics,ST)是一种用于从空间层面上解析RNA-seq数据的技术,利用该技术解析单个组织切片中的所有mRNA.空间条形码逆转录oligo(dT)引物在显微镜载玻片表面的有序附着,使得在mRNA样品处理和后续测序过程中编码和获取位置信息成为可能.与传统的转录组技术相比,空间转录组技术能获得细胞在组织原位环境下真实的基因表达特征,以及与微环境的关系,为基因表达提供高精度、高分辨率原位的空间信息.近年来,空间转录组技术取得了重要进展,检测的细胞通量、转录本数量和质量不断提高,空间定位信息更加准确全面,并已在拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)、杨树(Populus)等植物中展开研究.该文阐述了空间转录组技术在植物动态发育轨迹、不同组织和细胞类型差异分析、解码植物与微生物群相互作用等研究中的成功应用,讨论了空间转录组测序在植物组织原位测序中存在的问题和挑战,揭示了其在植物研究中的巨大潜力,为相关领域的进一步研究和应用提供了新的视角.
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关键词
空间转录组技术空间分布模式发育谱系细胞类型鉴定细胞间相互作用spatial transcriptome technologyspatial distribution patternsdevelopmental lineagescell type identificationcell-to-cell interactions
分类号
Q33（人工选择与自然选择）
栏目名称
DOI
10.7525/j.issn.1673-5102.2025.01.002
发布时间
2025-02-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
中国林木种子集团合作项目（2024-HXFW-168）
北京林业大学5·5工程科研创新团队项目（BLRC2023C06）
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