基于网络药理学及分子对接探究大黄-三七-蒲黄治疗脑出血的作用机制
Exploring the Mechanism of Rhubarb-Sedum Aizoon-Pollen in the Treatment of Intracerebral Hemorrhage Based on Network Pharmacology and Molecular Docking
摘要目的:在活血化瘀理论指导下,运用网络药理学及分子对接方法研究大黄-三七-蒲黄治疗 ICH的潜在作用机制.方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)、UniPort数据库获取大黄-三七-蒲黄活性成分及靶点蛋白,利用 GEO数据库获得 GSE24265 芯片基因表达谱,运用 R软件筛选 ICH疾病差异基因,并获取药物与 ICH交集靶点.运用 Cytoscape软件与 STRING数据库获得与靶点相关有效成分及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络.通过R Cluster Profiler对交集基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.使用 Cytoscape软件构建"药物有效成分-靶基因-KEGG网络",获得药物核心成分及作用靶点.运用 GSEA进一步富集核心靶点作用途径.运用 Autodock软件分子对接以验证核心成分、靶点的结合活性.结果:筛选获得大黄-三七-蒲黄治疗 ICH的核心成分为槲皮素、人参皂苷 Rh2、芦荟大黄素等;核心靶点为白细胞介素 1β(IL-1β)、白细胞介素 6(IL-6)、CXC趋化因子配体 8(CXCL8)、趋化因子配体 2(CCL2).核心靶点共同富集于 NOD样受体信号通路.分子对接显示,药物核心成分与核心靶点之间具有结合活性.结论:大黄-三七-蒲黄有效成分可通过 IL-1β、IL-6、CXCL8、CCL2 等靶点,调节 NOD样受体信号通路参与调控炎症反应、细胞凋亡等过程,起到对 ICH的治疗作用.
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