基于全外显子组测序的早发高血压合并血钾代谢异常病人易感基因的分子机制
Molecular Mechanism of Susceptibility Genes in Patients with Early-onset Hypertension Combined with Abnormal Potassium Metabolism Based on Whole Exome Sequencing
摘要目的:基于全外显子组测序和生物信息学分析,筛选早发高血压合并血钾代谢异常病人的易感基因,并探讨其潜在分子机制.方法:纳入57例早发高血压病人,根据入院时血钾水平将病人分为正常血钾组(血钾3.5~5.5 mmol/L,21例)和低血钾组(血钾<3.5 mmol/L,36例).采集外周血样本进行全外显子组测序及变异注释,筛选两组间交互性差异基因.采用DAVID平台进行基因本体(GO)功能富集、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.利用STRING数据库构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,并导入Cytoscape软件进行拓扑分析,识别关键节点基因和挖掘功能模块.通过酶联免疫吸附试验(ELISA)检测两组血浆Ⅳ型胶原α3链(COL4A3)及Ⅳ型胶原α5链(COL4A5)蛋白表达水平.结果:两组年龄、左室舒张早期快速充盈的充盈峰流速(E峰)、左室舒张早期快速充盈的充盈峰流速/左室舒张晚期充盈的充盈峰流速(A峰)比值(E/A)、血钾、血钙水平及脑卒中/脑梗死比例比较,差异均有统计学意义(P<0.05).基因筛查共识别出交互性差异基因63个.PPI网络拓扑分析显示,纤连蛋白1(FN1)、钾电压门控通道亚家族Q成员1(KCNQ1)、肌联蛋白(TTN)、神经纤维瘤病1型(NF1)、赖氨酸甲基转移酶2D(KMT2D)、胰岛素样生长因子2(IGF2)、Barttin蛋白(BSND)、钙电压门控通道亚家族α1 H亚基(CACNA1H)、钠通道上皮1型调节亚基γ(SCNN1G)、COL4A3及COL4A5等基因有较高的介数中心性(BC).分子复合物检测(MCODE)聚类分析发现,FN1与COL4A3、Ⅳ型胶原α4链(COL4A4)、COL4A5及Ⅴ型胶原α1链(COL5A1)构成紧密连接的功能模块,显著富集于整合素信号通路.低血钾组血浆COL4A3和COL4A5水平均低于正常血钾组(P<0.05).结论:通过外显子组测序和生物信息学整合分析筛选出FN1、KMT2D、NF1、TTN、COL4A3及COL4A5等早发高血压合并血钾代谢异常的潜在易感基因;其中,COL4A3与COL4A5可能是通过整合素信号通路参与疾病发生发展的关键分子,为阐明早发高血压的遗传机制提供了新的理论依据.
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