广藿香青枯病菌Kosakonia cowanii Pa82致病相关基因vgrG的功能鉴定
Functional Identification of the Pathogenicity-Related Gene vgrG in Kosakonia cowanii Pa82 Causing Bacterial Wilt on Pogostemon cablin
摘要目的:对广藿香青枯病菌Kosakonia cowanii Pa82(野生株Pa82)致病相关基因vgrG进行功能鉴定.方法:对野生株Pa82 及其vgrG基因突变的低致病力突变株进行转录组高通量测序,筛选与vgrG基因关联的差异表达基因并进行RT-qPCR验证;构建了vgrG基因突变株的基因回补株,并对其致病性相关表型进行了检测.结果:从vgrG基因突变株转录组测序数据中筛选得到 73 个与野生株Pa82 有差异表达的基因,其中vgrG及其下游基因JMT66_10485(10485)、JMT66_10490(10490)、JMT66_10500(10500)表达量同时下调,生物信息学分析表明基因vgrG、10485、10490 编码的蛋白与六型分泌系统(T6SS)的组装及其功能相关,10500 基因编码的蛋白为假定蛋白;RT-qPCR结果表明 4 个基因的表达趋势与转录组测序结果一致;采用三亲本杂交法,成功构建了vgrG基因突变株的vgrG、10485、10490、10500 基因的回补株C-vgrG、C-10485、C-10490、C-10500;RT-qPCR检测结果表明上述 4 个基因回补株中的vgrG、10485、10490、10500 基因的表达均得到恢复,且vgrG基因突变株中回补vgrG基因能同时恢复vgrG基因及其下游 3 个关联基因的表达;致病性实验表明,4 个基因回补株的致病力均恢复了野生株的表型;菌间竞争实验表明,回补株 C-vgrG、C-10500 细菌间竞争能力恢复了野生株的表型.结论:vgrG 基因及其下游基因10485、10490、10500 均为广藿香青枯病病原菌株Kosakonia cowanii Pa82 的致病相关基因,其中vgrG与 10500 基因在病原细菌与其他细菌拮抗中发挥重要作用;vgrG基因通过调控下游 10485、10490、10500 基因的表达,影响病原菌对广藿香的致病性.
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