换一批远志bHLH全基因组鉴定及表达分析
Identification and Expression Analysis of bHLH Genome-Wide from Polygala tenuifolia
摘要目的:对远志全基因组进行分析,获取远志bHLH转录因子家族的生物信息学特性和组织表达等信息,为远志bHLH基因功能的挖掘提供理论依据.方法:根据bHLH基因家族特征,从远志全基因组中筛选bHLH转录因子,并对其进行理化性质、细胞定位、进化树构建以及物种内共线性、基因表达模式等分析.结果:共鉴定出远志基因组中的 130 个bHLH转录因子,其编码蛋白的平均长度为368 个氨基酸,平均分子质量为40.90 kD,其中79 个为偏酸性蛋白,51 个为偏碱性蛋白;绝大部分 bHLH蛋白定位于细胞核.与拟南芥 bHLH 蛋白相比较,远志的bHLH蛋白可分为 18 个亚家族.远志bHLH基因中存在 1 组串联重复基因对和 71 对片段复制基因.根据远志根、茎、叶的转录组数据,其PtbHLH家族成员在不同组织中的表达具有特异性.进一步的相关性分析结果表明,部分PtbHLH基因的表达与皂苷合成相关酶基因显著相关.结论:该研究基本确定了参与远志皂苷合成相关基因的信息,为后续深入研究远志bHLH基因在生长发育、逆境响应期间基因组的动态以及在次生代谢物合成过程中的调控机制奠定了基础.
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关键词
远志bHLH转录因子全基因组鉴定生物信息学分析Polygala tenuifolia Willd.bHLH Transcription factorGenome-wide identificationBioinformatics analysis
分类号
R282.71（中药学）
栏目名称
DOI
10.13863/j.issn1001-4454.2025.08.009
发布时间
2026-03-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
中国博士后科学基金（GZC20230629）
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