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基于网络药理学和分子对接探讨黄芩-白术-茯苓治疗糖尿病的作用机制

Exploration on the mechanism of Huangqin-Baizhu-Fuling in treating diabetes mellitus based on network pharmacology and molecular docking

摘要目的:基于网络药理学的方法筛选石志乔主任常用药组黄芩-白术-茯苓中的活性成分,构建核心成分-疾病-靶点网络,探讨其治疗糖尿病的分子作用机制.方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),筛选得到黄芩-白术-茯苓中的活性化合物成分及相关靶点,通过检索Genecard、OMIM等数据库查找糖尿病靶点,对两者之间取交集,绘制韦恩图,通过Cytoscape 3.9.2构建药物-成分-靶点网络信息.基于生物信息学开源软件Bioconductor和R语言对黄芩-白术-茯苓的核心靶点进行基因本体论(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.选取度值排靠前的关键靶点和活性成分作为受体蛋白和配体小分子,采用AutoDockTools 1.5.6对配体和受体进行分子对接,并借助PyMOL将分子对接结果可视化.结果:黄芩-白术-茯苓中的主要活性成分baicalein(黄芩素)、hederagenin(常春藤皂苷元)、wogonin(汉黄芩素)、stigmasterol(豆甾醇)、rivularin(半枝莲种素)等可通过丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、白细胞介素(Interleukin,IL)-6、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、肿瘤蛋白 p53(Tumor Protein p53,TP53)、Jun原癌基因(Jun Proto-Oncogene,JUN)、前列腺素氧化环化酶 2(Prostaglandin-endoperoxide Synthase 2,PTGS2)、FOS 原癌基因(Fos Proto-Oncogene,FOS)、缺氧诱导因子-1α(Hypoxia Inducible Factor-1 Subunit Alpha,HIF1A)、雌激素受体 1(Estrogen Receptor 1,ESR1)、血管内皮生长因子A(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGFA)等靶蛋白介导糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation End Product,AGE)-AGE 受体(Receptor for Advanced Glycation End Product,RAGE)信号通路、IL-17信号通路、小细胞肺癌癌症信号通路、非酒精性脂肪肝信号通路、TP53信号通路治疗糖尿病.结论:该研究基于网络药理学多通路、多靶点、多成分的研究特点预测黄芩-白术-茯苓治疗糖尿病的作用机制,初步阐明黄芩-白术-茯苓中的活性成分与糖尿病的关系,为黄芩-白术-茯苓配伍的药效物质基础研究提供科学依据.

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