多水平转录组分析探讨慢性鼻窦炎伴鼻息肉"中医证候-分子机制"关联网络与鼻窦炎口服液干预机制的网络药理学分析
Multi-level Transcriptome Analysis to Explore the Association Network of"TCM Syndrome-Molecular Mechanism"of Chronic Rhinosinusitis with Nasal Polyp and the Intervention Mechanism of Bidouyan Oral Liquid
摘要目的 探讨慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)"中医证候-分子机制"关联网络,以及鼻窦炎口服液的干预机制.方法 通过转录组分析CRSwNP相关差异表达基因(DEGs),并将其与中医证候相关基因取交集,得到CRSwNP中医证候相关基因,然后进行基因本体论生物学过程(GOBP)和KEGG通路富集分析.通过单细胞转录组分析CRSwNP中医证候相关细胞类型及其标记基因.通过DCABM-TCM、Pubchem、SwissTargetPrediction、TCMSP和Uniprot数据库得到鼻窦炎口服液的入血成分及潜在作用靶点,将其与CRSwNP相关DEGs取交集,得到鼻窦炎口服液入血成分治疗CRSwNP的潜在作用靶点,并进一步评估鼻窦炎口服液干预CRSwNP的主要细胞类型及生物学过程.结果 共鉴定出62个CRSwNP中医证候相关独有基因,其中风热犯肺证12个、脾胃湿热证19个、脾肺气虚证7个及胆经湿热证24个,分别与凝血及细胞黏附、细胞发育、物质代谢及调节、神经系统发育及钙离子信号传导等生物学过程及信号通路密切相关.CRSwNP各中医证候相关基因均显著富集在白细胞介导免疫、淋巴细胞介导免疫、炎症反应调节等炎症免疫相关生物学过程及信号通路.单核巨噬细胞在CRSwNP风热犯肺证、胆经湿热证、脾胃湿热证等实证的作用评分中最高,B细胞在CRSwNP脾肺气虚证的作用评分中最高.鉴定出7个单核巨噬细胞的实证相关标记基因,实证高评分单核巨噬细胞(HM)的细胞通讯及细胞代谢水平与实证低评分单核巨噬细胞(LM)存在显著差异,HM的吞噬作用、炎症反应、氧化应激、细胞凋亡活性均高于LM.共得到50个鼻窦炎口服液治疗CRSwNP的潜在作用靶点;鼻窦炎口服液可能主要通过作用于循环细胞、分泌细胞、基底细胞、浆细胞、单核巨噬细胞等细胞类型来改善CRSwNP;潜在作用靶点主要富集在氧化应激、慢性炎症反应、上皮细胞增殖调节等相关生物学过程及信号通路.结论 CRSwNP相关风热犯肺证、胆经湿热证、脾胃湿热证和脾肺气虚证之间存在分子机制异质性;炎症免疫反应在CRSwNP相关中医证候发生发展过程中发挥重要作用;单核巨噬细胞在CRSwNP实证中扮演重要角色;鼻窦炎口服液通过多组分、多靶点、多通路协同机制治疗CRSwNP.
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