基于数据挖掘、网络药理学及分子对接探讨《中医方剂大辞典》治疗特发性肺纤维化用药规律及作用机制
Exploring Medication Rules and Mechanism in Encyclopedia of Chinese Medicinal Formulas for Treating Idiopathic Pulmonary Fibrosis Based on Data Mining,Network Pharmacology,and Molecular Docking
摘要目的 基于数据挖掘、网络药理学及分子对接探讨《中医方剂大辞典》(第 2 版)(以下简称《大辞典》)治疗特发性肺纤维化(IPF)的用药规律及作用机制.方法 以"肺痿""肺痹"为关键词筛选《大辞典》中治疗特发性肺纤维化的处方,依托古今医案云平台进行治疗特发性肺纤维化用药规律分析及处方挖掘,同时筛选出经典核心方,运用TCMSP、Herb及SwissTargetPrediction等数据库对核心方进行中药成分筛选及靶点预测,结合Genecards数据库筛选疾病靶点,通过Venny平台构建韦恩图获取交集,利用STRING平台构建蛋白互作网络,采用Cytoscape构建"经典核心方-中药-成分-靶点-疾病"网络并筛选关键靶点,通过Metaspace进行GO和KEGG通路富集分析,运用AutoDockTools、OpenBabel进行分子对接,以PyMOL实现可视化.结果《大辞典》中潜在的治疗特发性肺纤维化处方 222 首,中药 298 味,高频药物 24 味,核心药物组合 4 类,用药以养肺活血、化痰止咳为主,契合特发性肺纤维化气阴两虚、瘀痰阻络的病机.同时挖掘出 10 首经典方剂,其中相似度最高的"清肺汤"确立为经典核心方,进一步通过网络药理学分析显示其含有槲皮素、山柰酚、天竺葵色素等活性成分 62 个,作用于MMP9、AKT1、TNF、HIF1A等靶点,涉及激素反应、细胞迁移调控、HIF-1、Th17分化、AGE-RAGE等多种生物过程和信号通路,分子对接证实其关键成分与靶点结合稳定.结论《大辞典》中针对特发性肺纤维化的治疗遵循标本兼治原则,经典核心方清肺汤清养合治,化痰止咳,可以多靶点、多通路治疗特发性肺纤维化,为特发性肺纤维化治疗提供了新的思路.
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