换一批5起流感暴发疫情的病原学分子特征分析
Analysis of molecular characteristics of the pathogen causing 5 influenza outbreaks
摘要目的 对2023年11株甲型H1N1流感病毒进行全基因组遗传特性分析,为甲型H1N1流感的科学防控提供依据.方法 收集2023年2-3月的流感暴发疫情标本,将Ct＜30的标本进行分离培养,对11株甲型H1N1分离株构建文库并进行测序分析.在美国国家生物技术信息中心(national center for biotechnology information,NCBI)中下载疫苗株以及全球甲型H1N1代表株序列,使用软件BioAider V1.521对序列进行一致性分析和氨基酸变异位点分析.利用MEGA 11.0.13软件进行多序列比对并构建系统进化树,用在线软件TreeTime估算HA、NA基因的分子进化速率.结果 血凝素(hemagglutinin,HA)基因抗原决定簇Sb区发生Q206E变异,聚合酶碱性蛋白2(polymerase basic protein 2,PB2)的L475M均发生突变,聚合酶碱性蛋白1(polymerase basic protein 1,PB1)的I397M位点发生突变,这几处变异可能会影响病毒的致病能力和毒性等.遗传进化分析得出,11株本地甲型H1N1病毒株与疫苗株A/Victoria/2570/2019、参考株A/Rochester/U122/USA/2020、A/Rochester/U133/USA/2020遗传距离接近且同属于分支Ⅰ.全基因组进化分析结果显示,HA基因和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因符合严格分子时钟.结论 目前流感病毒仍在持续变异中,使用的疫苗株A/Victoria/2570/2019(H1N1)对人群依然有保护作用,要继续加强耐药监测,及时掌握流感病毒基因特性,进行科学防控.
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关键词
甲型H1N1流感全基因组测序同源性分析系统进化树氨基酸变异位点Influenza A H1N1Whole genome sequencingHomology analysisPhylogenetic treeAmino acid mutation site
分类号
R11（卫生基础科学）
栏目名称
发布时间
2025-07-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
南通市科技局基础科学研究项目（JCZ2022117）
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