换一批
换一批黄花蒿bHLH转录因子基因家族鉴定及光调控分析
Identification and Light Regulation Analysis of bHLH Transcription Factor Gene Family in Artemisia annua
摘要目的:基于黄花蒿全基因组及转录组数据,进行AabHLH基因家族生物信息学分析及在不同光处理下的基因表达分析.方法:基于基因隐马科夫模型(HMM)对AabHLH基因进行鉴定,利用Pfam、GSDS、MEME等在线分析软件对基因结构、分子进化及保守结构域等进行分析.结果:全基因组水平共鉴定出99条黄花蒿AabHLH基因,包含49对复制基因对;基于系统发育树将其分为13个亚族,所有亚族AabHLH蛋白亚细胞定位于细胞核且均为亲水性蛋白,同一亚族基因具有相似的外显子-内含子结构及保守基序.基因表达模式分析发现,AabHLH基因在不同水平上响应蓝光、红光、远红光、白光调控,推测其中6个亚族基因为光照条件下,7个亚族基因为非光照条件下青蒿素合成途径调控基因.结论:在全基因组水平鉴定了AabHLH基因,为深度解析AabHLH基因功能及其对光调控下青蒿素生物合成调控机制提供参考.
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分类号
R282
栏目名称
DOI
10.13313/j.issn.1673-4890.20200401006
发布时间
2021-06-15
基金项目
国家"重大新药创制"科技重大专项（2017ZX09101002-003-001,2019ZX09201005-006-001）；
国家自然科学基金项目（U1812403-1）；
北京城市学院2019年度实培计划项目（ZZ10-024）；
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项
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