换一批6株耐碳青霉烯铜绿假单胞菌的全基因组序列分析及痰热清注射液对其抑菌作用考察
Whole-Genome Sequence Analysis of Six Strains of Carbapenem-Resistant Pseudomonas aeruginosa and Antibacterial Effect of Tanreqing Injection
摘要目的:了解不同耐药表型的耐碳青霉烯铜绿假单胞菌(CRPA)的全基因组基本特征,并考察痰热清注射液(TRQ)对其抑菌作用,以分析CRPA的基因组多态性及其与临床药效的相关性.方法:选择 6 株不同耐药表型的CRPA,采用Illumina高通量测序法分析其多位点序列分型(MLST)及可移动元件,考察TRQ单用及与亚胺培南(IPM)联用对 6 株CRPA的药效作用,进一步分析各菌株基因组相关致病系统、比较分析核心基因与特有基因,并分析与β-内酰胺类耐药相关的代谢通路.结果:6 株CRPA的基因组大小差异较大(6.5～6.9 Mbp),分属于 5 种序列分型(ST),有 3 株归属于高危克隆型ST111(PA68、PA94)和ST235(PA115),各菌株的可移动元件在种类、数量及分布上存在显著差异;TRQ对高危克隆型菌株PA68、PA115 仅为抑菌作用,与IPM联用对非高危克隆型菌株具有协同或部分协同抑菌作用;6 株CRPA的耐药基因与毒力基因间无明显差异,耐药基因主要与增加抗生素外排、产生钝化酶、修饰抗生素主要结合靶点等相关,毒力基因多为攻击型毒力因子,主要与黏附、分泌、铁摄取相关;每株菌均含有特有基因,多与分泌系统、多药转运体及多药外排等基因相关;通过分析β-内酰胺类耐药相关代谢通路,可见 6 株CRPA的耐药性主要与外膜孔蛋白减少、外排泵、产生水解酶等相关.结论:CRPA携带大量的耐药基因及毒力基因,TRQ与IPM联用对非高危克隆型CRPA具有较好的协同抑菌作用,菌株的MLST及耐药表型或为TRQ临床药效差异的原因之一,为后续的分子流行病学、临床用药、致病性机制研究提供参考.
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关键词
耐碳青霉烯铜绿假单胞菌全基因组测序痰热清注射液耐药基因毒力基因carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosawhole-genome sequencingTanreqing Injectiondrug resistance genevirulence gene
栏目名称
DOI
10.13313/j.issn.1673-4890.20241202003
发布时间
2025-06-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
河南省科技研发计划联合基金项目（232301420083）
河南省中医药科学研究专项（2023ZXZX1026）
河南省高等学校重点科研项目（23A360008）
河南省高校科技创新团队项目（23IRTSTHN026）
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