基于生物信息学筛选帕金森病关键基因与信号通路
Identification of Key Genes and Signaling Pathways in Parkinson's Disease Based on Bioinformatics Analysis
摘要目的 通过生物信息学方法筛选与帕金森病(Parkinson's disease,PD)相关的关键基因、功能富集及信号通路.方法 从基因表达综合数据库(Gene expression omnibus,GEO)下载帕金森病芯片数据集GSE7621,运用加权基因共表达网络分析(Weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选关键基因模块,并使用R软件进行差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)的筛选.对筛选出的DEGs进行GO和KEGG通路分析,并通过STRING数据库和Cytoscape软件识别DEGs中的关键基因.结果 WGCNA和差异基因筛选共得到133个关键基因.GO与KEGG分析显示,主要生物过程涉及泛素化及组蛋白修饰.关键基因包括CUL7、KAT2A、DDB1、ANAPC7、ATXN7L2、TADA2B、SGF29、PSMB1、RSAD1及MRPL30.结论 本研究筛选出与帕金森病相关的关键基因,揭示了泛素化、组蛋白修饰等机制的潜在作用.结合中医辨证理论,为中医药治疗帕金森病的现代化研究提供了科学依据.
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