肠道菌群与膝骨关节炎因果关系的双向孟德尔随机化分析
Investigation on the causal relationship between gut microbiota and knee osteoarthritis:a bidirectional mende-lian randomization analysis
摘要目的:探讨肠道菌群与膝骨关节炎(knee osteoarthritis,KOA)的因果关系.方法:分别从MiBioGen和IEU OpenGWAS pro-ject 数据库中筛选获得肠道菌群的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)数据集和 KOA 的 GWAS 数据集.在分析工具R包中从肠道菌群的GWAS数据集中筛选符合要求的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点作为工具变量,根据筛选出的工具变量从KOA数据集中匹配相应的SNP位点.采用逆方差加权法、加权模式、简单模式、加权中位数和孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)-Egger回归法进行MR分析.采用MR-Egger截距检验检测水平多效性.采用Cochran's Q检验评估MR-Egger和逆方差加权法分析结果的异质性.采用MR-Steiger方向性检验判断2个变量之间是否存在显著的线性趋势.采用留一法评估MR分析结果的稳定性.以KOA的SNP位点作为工具变量,以正向MR分析中逆方差加权法所确定的与KOA存在因果关联的肠道菌群作为结局进行反向MR分析.结果:共筛选144个肠道菌群的SNP位点作为工具变量,F值范围为15.064~25.838;共筛选11个KOA的SNP位点作为工具变量,F值范围为19.102~35.742.正向MR分析结果显示,布劳特氏菌属、阿德勒菌属和土孢杆菌属与KOA发生风险呈负相关.MR-Egger截距检验和Cochran's Q检验结果显示,肠道菌群与KOA的因果关系均不存在水平多效性和异质性.MR-Steiger方向性检验结果表明,从肠道菌群到膝关节炎的方向上是稳健的.留一法检验结果显示,不存在对肠道菌群与KOA的因果关系造成严重影响的SNP位点,MR分析结果稳健.反向MR分析结果显示肠道菌群与KOA不存在反向因果关系.结论:布劳特氏菌属、阿德勒菌属及土孢杆菌属可能是对降低KOA风险有益的肠道菌群,这可作为通过肠道菌群干预KOA研究的线索和方向.
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