整合分析识别诊断甲状腺乳头状癌相关基因-论文-万方医学网

整合分析识别诊断甲状腺乳头状癌相关基因

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摘要目的： 　　通过发现潜在的与甲状腺乳头状癌相关的基因，为研究其发病机理及寻找、识别诊断的标志物打下基础。 　　方法： 　　通过整合分析基因芯片数据库去识别甲状腺乳头状癌与正常甲状腺组织之间的差异表达基因(differentially expressed genes，DEGs)。GO(Gene Ontology)功能聚类分析和KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）代谢通路聚类分析去发掘差异表达基因的功能。然后建立差异表达基因间的蛋白质相互作用(protein-protein interaction，PPI)网络。最后筛选出11个差异表达基因进行qRT-PCR验证。 　　结果： 　　获得了5个GEO（Gene Expression Omnibus）数据库。通过分析，154个差异表达基因被识别，包括26个上调基因和128个下调基因。在蛋白质相互作用网中，MLLT1、DLG2和EFEMP1是枢纽蛋白质，其中DLG2和EFEMP1与肿瘤的进程有关。在选择的11个上调和下调基因中，失调的TPO、MPPED2和CDH16基因有可能是与甲状腺乳头状癌最相关的肿瘤基因。 　　结论： 　　通过整合分析多基因的表达谱与我们验证的结果，推断下调的TPO和MPPED2将会成为诊断甲状腺乳头状癌最有可能的诊断标志物。