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摘要目的：从形态特征、药材性状、化学成分及遗传特性等各方面，研究四倍体黄芩新品系D20和二倍体黄芩的差异。为进一步开发四倍体黄芩新品系D20提供理论依据，使四倍体黄芩新品系D20在农业生产中产生更大的经济效益和社会效益。<br>　　方法：采用田间试验调查、根尖染色体鉴别、超高效液相色谱法和ISSR分子标记技术等方法，从植物学特征、药材性状、显微特征、化学成分和分子标记等方面，对四倍体黄芩新品系D20进行了研究。<br>　　结果：<br>　　1．四倍体黄芩新品系D20株型紧凑，植株高于二倍体黄芩；叶片为浅绿色，叶片较二倍体黄芩大且厚，叶片长度、宽度和叶柄长平均分别为3.37 cm、1.00 cm和0.41 cm，均大于二倍体黄芩，相比二倍体黄芩分别增加14％、63%和73%，叶片两面都有绒毛，叶背绒毛较少；花呈淡蓝紫色，较二倍体黄芩颜色淡且大；由于四倍体黄芩新品系D20的不育性，未能见到果实。<br>　　2．经根尖染色体鉴定，黄芩新品系D20根尖染色体为36。观察叶片气孔发现，黄芩新品系D20气孔的长和宽分别为16.67μm和9.5μm，比二倍体增加40%和72%；保卫细胞的长和宽分别是27.82μm和9.1μm，比二倍体黄芩增加30%和57%。<br>　　3．在外观性状方面：黄芩新品系D20相比于二倍体黄芩表现为根较粗壮肥实，为从生根，分支多；显微组织区别：二倍体黄芩根的横切面特征表现为皮层与韧皮部界限明显，四倍体黄芩D20皮层与韧皮部界限不明显；木射线宽广，较二倍体多；在粉末方面：韧皮纤维、石细胞较二倍体大。<br>　　4．四倍体新品系D20和二倍体黄芩化学成分指纹图谱相似度大于0.98，二倍体黄芩中黄芩苷、汉黄芩苷、黄芩素、汉黄芩素、野黄芩苷、木犀草素、芹菜素、芹菜素7-O-β-D-葡萄糖醛酸苷、千层纸素A质量分数分别为14.72±0.46%、5.84±0.31%、1.55±0.49%、0.72±0.21%、0.81±0.04%、1.47±0.17%、0.55±0.01%、0.31±0.04%、0.12±0.01%。四倍体黄芩中相应成分的质量分数分别为16.54±1.45%、6.62±0.39%、0.28±0.01%、0.20±0.02%、0.87±0.06%、1.50±0.19%、0.19±0.04%、0.32±0.01%、0.10±0.04%。<br>　　5．从100条引物中筛选得到9条ISSR引物用于正式扩增，共扩增70个位点，59条具有多态性位点，多态性百分率为84.2%；说明四倍体黄芩新品系D20和二倍体黄芩株系间具有中等偏高的遗传差异性。遗传距离的变异范围是0.0869~0.2429，UPGMA聚类树将黄芩样本分为两大类，二倍体聚为一类，四倍体聚为另一类。<br>　　结论：<br>　　1．四倍体黄芩新品系D20在农艺性状上优于二倍体黄芩。<br>　　2．两者在药材性状区别很大，组织结构和粉末差异较小。<br>　　3．四倍体黄芩新品系D20和二倍体黄芩化学组成基本一致，但各成分含量存在一定区别，除芹菜素、黄芩素、汉黄芩素、千层纸素A的含量四倍体比二倍体低外，其他5种成分的含量四倍体黄芩新品系D20均比二倍体黄芩高。<br>　　4．四倍体黄芩新品系D20和二倍体黄芩存在遗传差异，且ISSR分子标记能有效的揭示材料间的多态性。