医学文献 >>
  • 检索发现
  • 增强检索
知识库 >>
  • 临床诊疗知识库
  • 中医药知识库
评价分析 >>
  • 机构
  • 作者
默认
×
热搜词:
换一批
论文 期刊
取消
高级检索

检索历史 清除

中国寄蝇科(双翅目)DNA条形码及线粒体全基因组研究

摘要寄蝇科(Tachinidae)昆虫是双翅目物种多样性最大的科之一,目前国际最新分类系统记录世界寄蝇科有4亚科58族1500属约8500个有效种,中国记录有4亚科42族285属1253种,占全世界属、种的19.00%,14.74%。寄蝇科内物种多样性高,外部形态复杂性和趋同现象使得寄蝇科昆虫鉴定困难,而且重复性鉴定工作量巨大。<br>  DNA条形码物种鉴定利用COI前段658 bp长度的标准目的基因进行快速的物种鉴定,其原理是假设物种内部遗传距离差异远小于物种间的遗传差异,依据遗传距离的不同进行物种的快速区分。本研究提取了143头中国寄蝇科昆虫的核酸序列,经PCR实验和筛选后,最终获得74形态种108条序列。使用8种方法(NJ树、jMOTU、ABGD、TaxonDNA、bPTP、BarcodingR、GMYC、BLOG)进行DNA条形码技术在寄蝇科昆虫快速鉴定的适用性研究,并构建寄蝇科DNA条形码数据库。各DNA条形码鉴定程序鉴定结果如下:jMOTU鉴定成功率为94.44%;ABGD为91.67%;SpeciesIdentifier中 Best Match/Best Close Match/Cluster为98.03%,94.11%,81.48%;bPTP为79.63%;BarcodingR中的Bayesian、fuzzyId、bpNewTraining分别为96.55%,86.21%,89.66%;GMYC为89.81%;BLOG为73.68%。<br>  分析结果表明:DNA条形码技术在寄蝇科中的鉴定成功率高,但在一些物种中存在鉴定模糊的问题,仍需要进行少量的人工辅助鉴定。从鉴定结果来看,TaxonDNA中的Best Match方法鉴定成功率98.03%为最高,BarcodingR中的Bayesian方法鉴定成功率为96.55%。推荐使用这两种软件进行寄蝇科DNA条形码的分析研究和物种快速鉴定,而且前者操作难度更低。构建的数据库很好的鉴定出本实验涉及的寄蝇科昆虫,说明了数据库的有效性,为日后的研究提供实践基础。<br>  测定并注释了首个突颜寄蝇亚科线粒体全基因组代表种圆腹异突颜寄蝇Ectophasia rotundiventris(Loew,1858),序列全长(不含控制区)为14,843bp,包含37个基因;构建圆腹异突颜寄蝇以及包括丽蝇科的丝光绿蝇Lucilia sericata和麻蝇科的肥须麻蝇Sarcophaga crassipalpis作为外群共7种线粒体全基因组数据的NJ和ML方法的系统发育树,支持寄蝇科Tachinidae和追寄蝇亚科Exoristinae的单系性;突颜寄蝇亚科Phasiinae作为基部分支,与长足寄蝇亚科和追寄蝇亚科(Dexiinae+Exoristinae)为姊妹群。

更多
广告
分类号 Q963
发布时间 2019-01-17(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
  • 浏览0
  • 下载0

加载中!

相似文献

  • 中文期刊
  • 外文期刊
  • 学位论文
  • 会议论文

加载中!

加载中!

加载中!

加载中!

特别提示:本网站仅提供医学学术资源服务,不销售任何药品和器械,有关药品和器械的销售信息,请查阅其他网站。

  • 客服热线:4000-115-888 转3 (周一至周五:8:00至17:00)

  • |
  • 客服邮箱:yiyao@wanfangdata.com.cn

  • 违法和不良信息举报电话:4000-115-888,举报邮箱:problem@wanfangdata.com.cn,举报专区

官方微信
万方医学小程序
new医文AI 翻译 充值 订阅 收藏 移动端

官方微信

万方医学小程序

使用
帮助
Alternate Text
调查问卷