摘要乳腺癌是包括中国在内的许多国家的常见肿瘤、其较高的发病率和死亡率使其成为了一个重大的公共卫生问题,严重威胁女性的健康。乳腺癌是一种复杂的疾病,通常认为乳腺癌是由环境因素、生殖因素以及遗传因素造成的结果。新近研究发现 lncRNA 能够影响肿瘤的发展进程,并且出现了越来越多的SNP与肿瘤易感性之间的报道。MALAT1在包括乳腺癌在内的多种肿瘤组织中上调表达,并且与乳腺癌细胞的增殖和转移有关,是乳腺癌的危险因素。有研究显示BCAR4的高表达与非小细胞肺癌、骨肉瘤相关。在乳腺癌中,BCAR4的高表达量与乳腺癌病人的不良生存结局有关。据我们所知,目前没有研究报道MALAT1和BCAR4的遗传变异SNP与乳腺癌易感性之间的关系。<br> 目的<br> 探究MALAT1和BCAR4的六个标签SNP(rs3200401、rs619586、rs7929113、rs4561483、rs11649623、rs13334967)与乳腺癌遗传易感性之间的关联。并对实验结果中发现的有意义的SNP 位点进行功能验证,进而探索 lncRNA MALAT1和BCAR4的SNP在乳腺癌中的作用。<br> 方法<br> (1) 采用病例对照的研究方法,病例选取478例来自医院确诊的乳腺癌患者,对照489例来自健康调查人群。<br> (2) 根据NCBI、Ensembl、GVS等网站信息,利用haploview软件,得到中国人群的MALAT1和BCAR4的标签SNP信息。<br> (3) MALAT1的rs3200401、rs7929113,BCAR4的rs11649623位点采用限制性片段长度多态性聚合酶链式反应(PCR-RFLP )的分型方法;MALAT1的rs619586、BCAR4的rs4561483、rs13334967 位点采用创造性酶切位点(CRS-PCR-RFLP)的分型方法。<br> (4) 实时荧光定量PCR法检测有意义位点不同基因型的lncRNA相对表达量。数据分析采用SPSS21.0软件。病例和对照两组的基本特征的比较采用t检验和χ2检验;对照组中各SNP位点的频率分布采用Hardy-Weinberg平衡检验;六个SNP位点与乳腺癌之间的关联采用非条件logistic回归模型并调整其他因素;SNPs与生殖因素间的基因-环境交互作用用MDR软件分析;各lncRNA单体型分析采用SHEsis在线软件。<br> (5) MALAT1和BCAR4的相对表达量,采用2-ΔCt公式计算。<br> 结果<br> (1)MALAT1 rs3200401与乳腺癌患病的风险较低有关:相比于CC基因型携带者,CT基因型携带者患乳腺的风险降低了25%(CT VSCC,OR:0.75,95%CI:0.559-1.007);相比于CT基因型携带者,CC和TT基因型携带者患乳腺癌的风险降低了25.9%(CC+TT VS CT,OR: 0.741,95%CI: 0.552-0.993)。MALAT1 rs619586 与患乳腺癌的风险较低有关:相比于AA基因型携带者,AG基因型携带者患乳腺癌的风险降低了31.6%(AG VS AA,OR:0.684,95%CI: 0.478-0.979),AG+GG基因型携带者患乳腺癌的风险降低了32.5%(AG+GG VS AA,OR: 0.675,95%CI: 0.479-0.951);相比于AA+GG基因型携带者,AG基因型携带者患乳腺癌的风险降低了30.8%(AG vs AA+GG,OR:0.692,95%CI: 0484-0.989)。<br> (2)BCAR4 rs13334967与乳腺癌患病的风险较低有关,相比于AA基因型携带者,AT基因型携带者、TT基因型携带者可分别降低乳腺癌患病风险26.8%(AT VS AA,OR:0.732,95%CI:0.429-0.931)和26.9%(TT VS AA,OR:0.732,95%CI:0.511-0.990),AT+TT基因型可降低乳腺癌患病风险20.2%(AT+TT vs AA,OR:0.798,95%CI:0.571-0.970)。<br> (3)MALAT1的rs619586的AG(OR: 0.425,95%CI: 0.239-0.755)和AG+GG(OR:0.464,95%CI: 0.270,0.799)基因型与PR受体阳性状态有关联。<br> (4)MALAT1的单倍型 Crs3200401Ars619586Grs7027113 可能将乳腺癌患病风险提高35.8% (OR: 1.358,95%CI: 1.106–1.668),但是Crs3200401Grs619586Grs7027113可能将乳腺癌患病风险降低34.5%(OR: 0.655,95%CI: 0.475–0.904)。BCRA4的单倍型Grs4561483Grs11649623Ars13334967和 Ars4561483Ars11649623Ars13334967分别可能增加乳腺癌患病风险46.7%(OR:1.467,95%CI:1.217-1.768)和37.0%(OR:1.370,95%CI:1.102-1.844); 而 单 倍 型 Ars4561483Grs11649623Ars13334967 和Grs4561483Grs11649623Trs13334967 分别可能降低乳腺癌患病风险 19.7%(OR: 0.803,95%CI:0.653-0.989)和41.5%(OR:0.585,95%CI:0.429-0.798)。<br> (5)MALAT1rs619586 AG (0.827 ± 0.390)、GG (0.511 ± 0.149)基因型的携带者相比AA基因型(1.511 ± 0.437)携带者,其MALAT1相对表达量降低;BCAR4 rs1333496 AT(1.258±0.075)和TT基因型(0.970±0.152)携带者相比于AA基因型(2.171±0.130)携带者,其BCAR4相对表达量降低。<br> 结论<br> (1)携带MALAT1 rs619586的AG、GG基因型,rs3200401的CT基因型,BCAR4的rs13334967AT、TT基因型的个体可能降低乳腺癌的患病风险。<br> (2)携带rs619586的AG、GG基因型的MALAT1相对表达量比AA基因型的低。携带rs13334967 AT、TT基因型的BCAR4相对表达量比AA基因型的低。<br> (3)MALAT1 rs619586与乳腺癌的PR受体阳性相关。<br> (4)MALAT1 单 倍 型 Crs3200401Ars619586Grs7027113,BCAR4 单 倍 型Grs4561483Grs11649623Ars13334967和 Ars4561483Ars11649623Ars13334967均有可能增加乳腺癌的患 病 风 险 ;而 MALAT1 单 倍型 Crs3200401Grs619586Grs7027113 、 BCAR4的Ars4561483Grs11649623Ars13334967和 Grs4561483Grs11649623Trs13334967单倍型均有可能降低乳腺癌患病风险。
更多相关知识
- 浏览0
- 被引0
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文