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促性腺激素垂体腺瘤相关基因的生物信息学研究

摘要目的:通过生物信息学发掘促性腺激素垂体腺瘤差异表达基因,在组织水平运用免疫组化及Western-Blot方法验证相关基因产物的表达情况。<br>  方法:利用NCBI数据库中的GEO基因芯片公共数据库,进行芯片数据检索,最终选择芯片为(GSE26966)的数据作为分析对象,使用boconductor包中R工具的函数及Limma程序包,选择错误发现率FDR小于0.05以及log2FC的绝对值大于2为标准识别差异性表达基因,应用DAVID数据库对差异表达基因进行GO功能富集分析和KEGG通路分析,选用Strin g在线数据库构建差异表达基因的PPI网络,收集PPI通路中相关度最高的基因作为研究目的基因。通过收集临床促性腺激素垂体腺瘤和无功能垂体腺瘤组织,用免疫组化和Wb的方法,用Image Pro Plus6.0软件提取图像数据,用Graphpad Prism6.0软件进行数据统计分析,验证目的基因翻译产物在促性腺激素垂体腺瘤和无功能垂体腺瘤上表达的差异。<br>  结果:通过对GSE26966基因芯片的分析,得到796个差异表达基因,其中上调差异基因223个,下调差异基因563个;上调差异基因KEGG通路主要有:Retrograde endocannabinoid signaling(逆行性大麻素信号通路);而下调差异基因KEGG通路主要为MAPK signaling pathway(丝裂原活化蛋白激酶信号通路)、PI3K-AKT signaling pathway(磷脂酰肌醇激酶-蛋白激酶信号通路)。通过PPI通路富集Hub基因为c-fos;通过收集临床促性腺激素垂体腺瘤8例和无功能垂体腺瘤组织12例,用免疫组化和Wb的方法,验证目的基因c-fos翻译产物fos蛋白在促性腺激素垂体腺瘤上的表达明显低于无功能垂体腺瘤(*p<0.05)。<br>  结论:在促性腺激素垂体腺瘤中MAPK signaling pathway(丝裂原活化蛋白激酶信号通路)被抑制,其通路中下游c-fos基因的抑制及其产物fos蛋白低表达与促性腺集素垂体腺瘤的发生相关。

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