换一批
换一批摘要人类基因组计划完成之后，掀起了对miRNA研究的热潮。大量研究表明，miRNA虽不参与编码蛋白，但广泛参与人类编码基因表达的调控，人类约三成的编码基因都在不同的水平受到miRNA调控。随着高通量测序技术和微阵列技术的发展，被确认功能的miRNA急剧增加。这使得通过科学计算的方法，对miRNA功能进行深入研究成为可能。人们不断挖掘miRNA与疾病之间潜在的关联规则，对其调控机制进行深入分析和研究。<br> 首先，本文在原有人类miRNA富集分析工具TAM的基础上，从权威数据库miRBase、HMDD中收集近年来相关的miRNA数据，并对数据进行整理，更新了原数据库中的miRNA功能集合、miRNA家族集合、miRNA簇集合和与疾病相关的miRNA集合。此外，为了充分研究人类miRNA对疾病的上下调功能，本文在该数据库中首次建立了miRNA上下调疾病数据集合。<br> 其次，本文设计并实现了Web版TAM2.0系统。该系统在增加了对用户给出的miRNA列表与miRNA上下调疾病数据集合中的miRNA进行相关性分析的功能，并将分析结果进行可视化处理，方便用户对感兴趣的上下调miRNA基因进行有关疾病调控的相关性分析。针对miRNA集数量的急剧增加，TAM2.0系统还增加了对miRNA集进行查询、结果保存以及对结果可视化显示等功能，更加方便用户对miRNA进行功能富集分析。<br> 最后，为使miRNA的数据库具有普及性，更容易实现推广，在无网络环境的条件下仍能方便地对miRNA集进行富集分析。本论文基于Python的wxPython库，设计并实现了TAM2.0系统的单机版TAMgui。其具有可离线下载、无网状态下使用的特点，更加方便用户使用。
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