摘要背景与目的:<br> 甲状腺是位于颈部的蝴蝶形腺体,可分泌多种激素,发挥调节血压、体温、心率、代谢和体重等生理功能。甲状腺癌(TC,Thyroid carcinoma)是最常见的内分泌恶性肿瘤之一。近年来,甲状腺癌在中国及世界范围内的发病率上升趋势明显。<br> 目前,细针穿刺细胞学检测(FNAC,Fine needle aspiration cytology)是美国甲状腺协会推荐的标准化临床操作,为甲状腺结节临床评估中最准确及经济的方法。然而,约30%的病例得出的细胞学结果不确定,需要进行部分或完全甲状腺切除并完成进一步的组织病理学检查。在临床上建立更好的早期诊断方法,精准地确定结节的良恶性,仍然具有一定的挑战。发现并筛选新的具有潜在应用价值的甲状腺癌生物标志物,提高甲状腺癌患者早期诊断的精准性,特别是对细胞学结果不确定患者的术前评估具有重要意义。<br> 方法:<br> 本研究使用WGCNA方法对来源于NCBI表达谱数据库的265例细胞学结果不确定的甲状腺结节的基因表达谱数据进行显著相关基因分析,从而获得与恶性组织学特征显著相关的基因模块。该结果进一步在来源于cBioPortal癌症病例基因组学数据库的3个独立数据集中进行验证。同时,本研究工作使用基因本体(GO,Gene Ontology)功能注释和KEGG通路富集分析方法对相关基因涉及的肿瘤发生信号通路进行分析。分析发现的甲状腺癌早期相关基因经qRT-PCR和Western Blot实验在细胞水平上进行验证。同时,通过分析84例甲状腺病人临床信息中的危险相关因子,建立了依据这些危险相关因子筛选高风险病人的模型。<br> 结果:<br> 1)WGCNA鉴定蓝色模块与组织病理学恶性特征具有最高的相关性(cor=0.77)及显著性(p=6.8e-6)。<br> 2)经原数据集和3个独立数据集验证,发现15个基因(CC2D2B,CFH,CITED1,FN1,G0S2,GABRB2,KRT19,TENM1,PPP2R2B,PROS1,RXRG,SCEL,SERGEF,SLC34A2和STK32A)在甲状腺恶性肿瘤中显著高表达。其中,5个基因具特异点突变,分别是FN1(R534P),PROS1(K200I,Q571K),SCEL(T320S),SLC34A2(T688M)和TENM1(S1131F),可能是甲状腺癌早期诊断的潜在生物标志物。<br> 3)对蓝色模块中的基因进行GO分析和KEGG通路分析,发现这些基因主要集中在参与激素和类固醇激素的生理反应、调节细胞迁移和粘附、细胞连接相互作用等通路中;参与的途径主要集中在甲状腺癌、小/非小细胞肺癌、癌症的发生、信号传导、细胞外区域和转运蛋白活性上。<br> 4)qRT-PCR实验验证10个基因(FN1,PROS1,TENM1,SCEL,SLC34A2,CITED1,GABRB2,KRT19,RXRG和STK32A)的转录水平,结果表明,与正常甲状腺细胞相比,甲状腺癌细胞中这10个基因的转录水平均升高。<br> 5)Western Blot结果表明,与正常甲状腺细胞相比,SLC34A2在甲状腺癌细胞中显著高表达。<br> 6)小样本临床数据分析表明,50~54岁年龄段的女性是甲状腺癌的易感人群,但年龄和最大肿瘤直径在低风险和高风险甲状腺患者中没有显著差异。
更多相关知识
- 浏览26
- 被引2
- 下载29
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文