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摘要目的：呼吸道感染是人类最常见的疾病，具有发病率高等特点，目前以成为全球公共卫生的重要问题。面对呼吸道感染疾病防控工作的严峻形势，阐明呼吸道感染病原体流行特征与基因特征，是呼吸道疾病预防与控制的关键。本研究旨在阐述清楚这些病原体的病原谱与其流行特征。同时，进一步分析腺病毒的基因特征。为呼吸道感染的防控工作提供科学的参考依据。<br>　　方法：以广东省妇幼保健院与广东省第二人民医院作为哨点医院，收集医院呼吸道感染患者的呼吸道样本与病例信息。呼吸道样本通过冷链运输到广东省疾病预防与控制中心，通过全核酸提取与多病原检测，获取病原体检测结果，结合患者的病例信息进一步分析病原体的流行特征。经过多病原检测的腺病毒阳性样本，通过Hep-2细胞对病毒进行分离培养，通过二代测序技术获取腺病毒的全基因组序列，使用CLC、BioEdit和MEGA等基因分析软件对序列进行拼接、校准与建立亲缘进化树，对腺病毒的型别与基因特征进行分析。<br>　　结果：<br>　　1.本研究一共纳入患者1513例，其中单重感染有960例，占比63.45%；双重感染有258例，占比17.05%；三重或以上感染48例，占比3.17%。阴性样本247例，占比16.33%(247/1513)。检出结果中前五位的病原体分别是：H1N12009、RhV、AdV、FluB和RSV。<br>　　2.CoVOC43在男性检出率为8.74%，在女性检出率为5.95%，CoVOC43在男性检出率偏高，差异具有统计学意义。<br>　　3.分析年龄与病原体总体检出率的关系：1~岁组检出率(83.2%)、2~岁组检出率(90.75%)和5~岁组检出率(88.79%)，该三组人群相对于14~岁组检出率(68.27%)较高，差异具有统计学意义；各种病原体PIV、RSV、AdV、RhV、CoV和BoV在儿童检出率较高,FluB在成年人检出率较高，差异具有统计学意义。<br>　　4.FluA与H1N12009在门急诊患者检出率(54.36%和49.39%)相对于住院患者检出率(26.76%和22.96%)偏高；FluB与MP在住院患者检出率(13.47%和2.74%)相对于门诊患者的检出率(1.01%和0.51%)偏高，差异具有统计学意义。<br>　　5.FluA与H1N12009在上呼吸道感染患者检出率(52.56%和47.76%)相对于下呼吸道感染患者检出率(37.2%和31.1%)偏高；RSV和MPV在下呼吸道感染患者检出率(18.9%和7.93%)相对于门诊患者的检出率(4.48%和3.41%)偏高，差异具有统计学意义。<br>　　6.36份腺病毒培养物中，主要的腺病毒型别有AdV-3,有21例，；其次是AdV-1和AdV-2，都是6例；再次是AdV-55，2例；最后7型检出1例。<br>　　7.腺病毒进化非常稳定，没有随着时间和地域发生明显的改变。<br>　　8.AdV-55分离株是由AdV-14和AdV-11重组而来。<br>　　结论：<br>　　1.呼吸道感染患者中，病原体总体检出率为83.67%，主要感染为病毒性感染。FluA与RhV是近年广州市呼吸道感染的重要病原体。<br>　　2.不同性别病原体检出率不具有差异性。<br>　　3.儿童是近年呼吸道感染病原体的易感人群。儿童患者更容易检出PIV、RSV、AdV、RhV、CoV和BoV；FluB成年人感染风险更高。<br>　　4.H1N12009在上呼吸道感染患者检出率偏高，而RSV和MPV在下呼吸道感染患者检出率偏高。<br>　　5.腺病毒流行的常见型别有腺病毒1型、腺病毒2型、腺病毒3型、腺病毒7型和腺病毒55型，其中腺病毒3型为该地区的优势株。<br>　　6.常见的腺病毒腺病毒1型、腺病毒2型、腺病毒3型、腺病毒7型和腺病毒55型均未发现明显变异。<br>　　7.AdV-55分离株是由AdV-14和AdV-11重组而来。