摘要目的:<br> 分析TCGA数据库胃癌样本中差异表达的lncRNA以及lncRNA与患者预后的关系,确定研究对象。结合TCGA数据库中胃癌的临床数据对研究对象lncRNA BCAR4的表达水平与临床病理特征的关系进行探讨,并通过体外实验研究lncRNA BCAR4在胃癌中的表达水平及其对胃癌细胞生物学行为的影响。<br> 方法:<br> 从TCGA数据库下载344例胃癌组织和30例正常组织的lncRNA、mRNA表达数据和临床信息,利用生物信息学的方法对胃癌组织和正常组织中差异表达的lncRNA进行筛选,并分析lncRNA与患者预后的关系。根据差异基因的表达水平以及与胃癌患者预后的相关性,确定lncRNA BCAR4为研究对象,并分析其表达水平与胃癌患者临床病理特征之间的关系。进一步通过皮尔森相关系数分析lncRNA BCAR4的共表达基因,探索其可能的作用机制。最后采用qRT-PCR检测胃癌组织和胃癌细胞系中lncRNA BCAR4的表达情况,并通过CCK8实验和Transwell实验进一步研究lncRNA BCAR4对胃癌细胞增殖和侵袭能力的影响。<br> 结果:<br> 1.通过生物信息学分析共筛选出625个在胃癌中差异表达的lncRNA,其中520个lncRNA在癌组织中表达上调,105个lncRNA在癌组织中表达下调。并且有43个差异表达的lncRNA与胃癌患者的预后相关。<br> 2.临床相关性分析显示lncRNA BCAR4的表达水平与胃癌患者的T分期、M分期有关,但与性别、年龄、临床分期无关。<br> 3.皮尔森相关系数分析发现4个可能与lncRNA BCAR4共表达的基因,包括CTD-2530H12.1、RNF6P1、RP11-348M3.2和RP11-419L9.1。<br> 4.qRT-PCR实验发现,胃癌组织中的lncRNA BCAR4表达水平明显高于正常组织。此外,与正常胃黏膜上皮细胞株相比,lncRNA BCAR4在胃癌细胞株中均表达上调。<br> 5.CCK8实验和Transwell实验结果显示,敲低lncRNA BCAR4的表达会抑制胃癌细胞的增殖和侵袭能力。<br> 结论:<br> LncRNA BCAR4在TCGA数据库胃癌样本中明显高表达并且与胃癌者的T分期、M分期以及预后显著相关。LncRNA BCAR4在胃癌组织和细胞系中均表达上调,干扰该lncRNA的表达能够抑制胃癌细胞的增殖和侵袭能力。LncRNA BCAR4在胃癌中可能发挥促癌基因的作用,是胃癌潜在的治疗靶点和预后的标志物。
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