摘要【目的】<br> 探讨长链非编码RNA(lncRNA)HOTAIRM1在氢醌(hydroquinone, HQ)诱导TK6恶性转化细胞和苯暴露工人血液标本中异常表达的分子机制。<br> 【方法】<br> 1.细胞及苯暴露工人的选择<br> 人类正常淋巴母TK6细胞是由四川大学张立实教授所赠送,HQ诱导TK6恶性转化细胞由课题组前期建立,并命名为HQ-MT细胞;以109例苯暴露工人为研究的苯暴露的研究对象,并根据暴露组的年龄、性别、吸烟和饮酒史,将非苯暴露组进行1:1配对。<br> 2.药物的处理<br> 使用DNMT甲基化转移酶抑制剂(5-aza-2’-deoxycytidine, 5-AzaC)、组蛋白去乙酰化抑制剂(trichostatin A, TSA)处理HQ-MT细胞,培养24h,收集细胞并进行相关检测。<br> 3.基因表达水平的检测<br> 细胞和血液总RNA分别时使用TRIzol试剂和PureLink?RNAMiniKit试剂盒进行提取,反转录生成cDNA后采用实时荧光定量PCR检测细胞lncRNA及相关mRNA的表达水平。收集细胞后使用裂解液,裂解细胞提取总蛋白,通过用BCA法检测蛋白浓度,Westernblotting的方法检测相关蛋白的表达水平。<br> 4.甲基化特异性PCR(Methyl-spscific PCR, MSP)检测基因启动子区甲基化水平<br> 在数据库中查找基因启动子区上游2000bp的DNA序列,并用MethPrimer软件对启动子区的CpG岛进行了分析并设计引物,使用PCR法将已经进行甲基化修饰的DNA样品检测其甲基化水平。<br> 5.生物信息学的分析<br> 在生物信息网站(http://pridb.gdcb.iastate.edu/RPISeq/)预测RNA与蛋白质的相互结合作用。<br> 6.DNMT3b敲除细胞株的构建<br> 采用CRISPR/CAS9基因编辑方法,在课题组前期建立的CAS9稳定转染HQ-MT细胞株,再转染空载体或靶向敲除DNMT3b的慢病毒,使用单克隆方法挑选出稳定的细胞株,用qRT-PCR和Westernblotting对DNMT3b表达量进行敲除鉴定。<br> 7.统计分析<br> 实验结果的各项指标通过使用SPSS软件进行统计学分析。计量资料采用表示,采用t检验进行组间比较,检验水准ɑ=0.05。<br> 【结果】<br> 1.LncRNAs在HQ-MT细胞中的表达情况<br> qRT-PCR检测结果显示,HOTAIRM1、LncRNAPLIN2、LncRNA-CRNDE和LINC-PINT的表达水平,与PBS对照组相比,HOTAIRM1的表达量在HQ-MT细胞中的表达水平下降,而LINC-PINT的表达升高。<br> 2.5-AzaC和TSA处理HQ-MT细胞对lncRNAs和DNMT3b表达水平的影响<br> 与PBS对照组相比,5-AzaC或TSA处理HQ-MT细胞,可以使HOTAIRM1的表达水平升高;5-AzaC处理HQ-MT细胞对lncRNACASC15的表达水平升高;而TSA处理HQ-MT细胞对LUNAR1的表达水平升高;DNMT3b在5-AzaC或TSA处理组中表达均下降。<br> 3.HOTAIRM1和DNMTs在HQ早期处理细胞中的表达情况<br> 与对照组相比,HQ处理细胞24h、48h、72h后HOTAIRM1的表达升高,但与48h相比,72h的表达明显下降;DNMT1、DNMT3b的表达下降,而DNMT3a的表达并无明显变化。<br> 4.苯暴露人群血液中HOTAIRM1的表达与苯暴露时间有关<br> 以非苯暴露工人为对照组,检测HOTAIRM1在苯暴露工人中的表达,在1.5年苯暴露时间内,HOTAIRM1的表达升高;而其余暴露时间较长,HOTAIRM1平均表达减少。相关分析HOTAIRM1在苯暴露工人中的表达与苯暴露时间的关系,结果发现随着苯暴露时间的增加,HOTAIRM1的表达下降。<br> 5.DNMT3b调节HOTAIRM1的生物信息预测<br> 经过分析HOTAIRM1的CpG岛,进行生信预测结果发现存在与DNMT3b结合的位点;进一步在生物信息网站上预测HOTAIRM和DNMT3b的相互作用,结果显示RF与SVM值均大于0.5,提示两者间存在相互调控的作用。<br> 6.HOTAIRM1启动子区甲基化的情况<br> 提取PBS组、HQ-MT细胞以及5-AzaC和TSA处理HQ-MT细胞的DNA进行MSP检测,结果表明,在HQ-MT细胞中HOTAIRM1的甲基化水平升高,经5-AzaC和TSA处理后其甲基化水平下降。在苯暴露工人中,其启动子区甲基化水平与HOTAIRM1的表达水平呈负相关。<br> 7.DNMT3b介导的启动子高甲基化导致HOTAIRM1下调<br> 与KO-DNMT3b-NC对照组细胞相比,在HQ-MT细胞敲除DNMT3b后,HOTAIRM1的表达升高,通过MSP方法检测启动子甲基化水平,甲基化程度下降。<br> 【结论】<br> 1.HOTAIRM1在TK6细胞和苯暴露工人中表达随HQ处理或苯暴露时间的延长先升高后降低。<br> 2.在HQ-MT细胞中DNMT3b上调诱导的启动子区DNA高甲基化从而抑HOTAIRM1的表达。
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