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摘要microRNAs(miRNAs)是一类重要的基因调控因子，在细胞发育、分化、增殖和凋亡、病毒防御以及疾病发生发展过程中发挥着重要的调控作用。大量科学研究表明,人类疾病与miRNAs的调控功能异常密切关系。一个miRNA的调控功能失调可导致多种疾病的发生；一种疾病的产生与多个miRNAs的调控功能失调相关。因此，明确识别miRNAs的调控功能有助于人类在分子水平理解疾病的产生、发展机制，对筛选复杂疾病的miRNAs分子标志物，复杂疾病的诊断和治疗具有重要意义。<br>　　miRNAs数量众多，但具有明确调控功能的miRNAs比例较低。利用传统生物实验方法识别miRNAs与复杂疾病间的调控功能存在时间长，费用高等问题。因此，通过计算方法研究miRNAs之间的功能相似性，识别出具有相似功能的miRNAs，推测miRNAs与复杂疾病间的调控关系是当今miRNAs研究工作的一项重要内容。<br>　　本文针对目前miRNA功能相似性的计算方法进行深入分析，针对其中存在的问题，提出了新的计算miRNAs之间功能相似性的计算方法。该方法针对当前miRNA功能相似性计算方法存在的问题，结合miRNAs与疾病间关系的研究成果，将miRNAs对疾病的调控信息引入到miRNAs的特征构建中，提出了一种基于加权疾病语义信息的miRNA功能相似性计算方法。该方法在继承基于疾病语义信息计算miRNA功能相似性方法优点的同时，进一步深入分析并利用miRNAs对疾病调控的方向性信息，以期望能够更加准确、合理地计算miRNAs的功能相似性。<br>　　本文在HMDD和TAM数据集上与其它三种基于疾病计算miRNA功能相似性的计算方法进行实验对比，并利用miRNA功能相似性研究中常用的评价方法对其进行比较。最终的实验结果表明，本文所提方法具有更好的计算效果。<br>　　为了方便研究人员对miRNAs的功能进行深入的研究，本文设计并实现了miRNA功能分析的在线服务平台。该平台不但提供了在线计算miRNAs之间功能相似性的功能，还提供了计算结果可视化展示的功能。此外，为了帮助研究人员更加深入地研究miRNAs对疾病的调控作用，该系统还提供了miRNAs的富集分析功能以及预测miRNAs与疾病间关系的功能，并支持用户下载分析结果，为研究miRNAs的功能提供了一个方便的分析工具。