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冠状病毒与宿主相互作用的关键基因筛选

摘要冠状病毒属巢式病毒目冠状病毒科的成员,是迄今发现的基因组最大一类RNA病毒,为人畜共患的高致病性病毒。其中SARS-CoV和MERS-CoV是目前对人类健康造成严重威胁的冠状病毒,使得对该类病毒的研究刻不容缓,但是由于SARS-CoV和MERS-CoV均为高致病性病毒的危害性,对它们的研究受到各种因素的限制。冠状病毒中的鼠肝炎病毒(Mouse Hepatitis Virus,MHV)作为冠状病毒研究中的模式病毒,在细胞水平、动物水平上都是研究得较透彻的冠状病毒,通常会被作为研究人类其他冠状病毒感染的安全模型,通过对其的研究,可以促进对其他冠状病毒及人类冠状病毒的了解。<br>  本次实验利用MHV感染小鼠来源的树突状细胞(Bone marrow-derived dendritic cell, BMDC),使用不同病毒(MHV, VSV,HSV-1)感染细胞,模拟人病毒对免疫细胞的急性感染,检测刺激细胞产生的干扰素以及其他细胞因子,再通过转录组测序以及蛋白质组测序得到在病毒感染前后以及感染不同时间点内,从整体上分析细胞内发生了差异表达的基因/蛋白。使用GO基因注释以及KEGGpathway富集分析,按照基因/蛋白参与的生物学过程,分子功能,以及细胞组分,将各基因/蛋白分类。从中筛选出在各通路有重要作用的基因/蛋白为研究对象,通过RNA干扰降低该基因的表达后,检测其对病毒复制的影响,从而寻找冠状病毒急性感染中细胞的关键限制因子,为日后作用机制的研究探寻提供依据,最终对抗病毒研究提供新的思路和理论基础。

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