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环状RNA hsa_circ_0000522在胃癌中的表达及临床意义

摘要目的<br>  胃癌是目前最常见的消化道肿瘤之一,在所有已知癌症中,胃癌的发病率为第五位,死亡率为第三位。其中每年新增的胃癌病例中以亚洲人群为首位,其新增及死亡病例占全世界胃癌人群50%以上。同时在所有亚洲国家中,无论是发生率还是死亡率中国排名第一,这与我国庞大的人口基数与相对缺乏的医疗资源之间的不平衡有着密切联系。虽然早期胃癌的治疗预后相对较好,甚至5年生存率可达90%,但由于患者发现胃癌时往往已经是中期,甚至晚期,所以急需一种非创伤性、价格低廉、有一定特异度及敏感度的诊断方法以提高胃癌的早期检出率。<br>  近几年来,随着各国研究人员的不断探索,发现环状RNA(circularRNA,circRNA)与肿瘤的发生、发展、转移、预后等有着密切的关系。研究表明,circRNA通过多种方式来影响肿瘤发生,例如调控细胞功能、通过与蛋白质的相互作用、缺氧诱导作用等方式。<br>  本课题通过预实验筛选出hsa_circ_0000522为目标circRNA。通过研究hsa_circ_0000522在胃癌组织及癌旁组织中的表达水平以及两者之间是否存在差异性表达,进一步探索hsa_circ_0000522在胃癌组织中的表达意义,并分析其作为新型分子标志物、治疗靶点和判断预后指标的可能性。<br>  方法<br>  1.收集胃癌及癌旁组织,储存在-80℃的冰箱内。<br>  2.本实验组织样本均经过病理学证实为胃癌,肿瘤的分期按照国际上最为通用的肿瘤-淋巴结-转移(TNM)分期系统(第8版)。组织学分级按照美国国立综合癌症网络(NationalComprehensiveCancerNetwork,NCCN)胃癌临床实践指南(v.1.2019)进行严格的评估。<br>  3.通过FFPERNAKit方法提取样本总RNA,使用超微量紫外可见分光光度计DS-11(丹诺尔,美国)检测所提取总RNA的量,将提取后的总RNA保存在-80℃超低温冰箱中。<br>  4.使用GoScript反转录系统试剂盒(普洛麦格,美国)将总RNA反转录成为互补DNA(complementaryDNA,cDNA)。<br>  5.以反转录生成的cDNA为模板在Mx3005P实时荧光定量PCR仪器(安捷伦,美国)上通过实时定量-逆转录-聚合酶链反应(quantitativereversetranscriptionpolymerasechainreaction,qRT-PCR)进行扩增。实时PCR反应一式两份以减少误差,通过基因测序确认产物是否正确。<br>  6.通过qRT-PCR检测hsa_circ_0000522在胃癌组织以及相对应的癌旁组织中的表达水平,分析has_circ_0000522在两者之间是否存在差异性表达。<br>  7.通过SPSS21.0软件(IBM,美国)分析hsa_circ_0000522的表达水平与临床病理因素之间是否存在相关性,是否具有统计学意义,并且使用GraphPadPrism7.0(GraphPadSoftware,USA)来绘制所需图示。<br>  8.使用MedCalc19(MedCalcSoftware,USA)绘制受试者工作特征(receiveroperatingcharacteristiccurve,ROC)曲线,通过其特异度及灵敏度来评价hsa_circ_0000522对胃癌诊断的潜能。<br>  结果<br>  1.本课题从Circ2Traits(http://gyanxet-beta.com/circdb/)数据库中筛选出与胃癌相关并且未被进一步研究过的circRNA,通过少量样本的前期预实验证实<br>  hsa_circ_0000522在胃癌及癌旁组织中存在差异性表达,将其作为本次实验中的目标circRNA。<br>  2.根据qRT-PCR结果发现hsa_circ_0000522在胃癌组织中的表达水平显著下调且具有统计学意义(P<0.05)。<br>  3.根据所收集的临床病理因素内容,结合qRT-PCR结果,分析发现hsa_circ_0000522与肿瘤的大小(P=0.005)、肿瘤的分化程度(P=0.027)、有无神经侵犯(P=0.024)密切相关。<br>  4.绘制ROC曲线,根据图示得出hsa_circ_0000522对诊断胃癌有较低的准确性(AUC(ROC曲线下面积)=0.658),特异性为70.6%,敏感性为63.5%。<br>  5.绘制生存曲线,根据曲线结果发现胃癌组织中hsa_circ_0000522高表达的患者生存时间显著大于hsa_circ_0000522低表达的患者。<br>  结论<br>  通过qRT-PCR技术我们发现与癌旁正常组织相比,胃癌组织中hsa_circ_0000522的表达水平显著下调且具有统计学意义(P<0.05),且hsa_circ_0000522的表达水平与肿瘤的大小(P=0.005)、肿瘤的分化程度(P=0.027)、有无神经侵犯(P=0.024)相关密切。结合ROC曲线以及生存曲线结果,hsa_circ_0000522可能具有成为新型胃癌筛查分子标志物的潜能,hsa_circ_0000522高表达患者生存时间显著高于hsa_circ_0000522低表达患者,表现为抑癌作用,对判断胃癌预后具有重要意义。

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导师 叶孟
发布时间 2021-11-24(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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