摘要糖尿病肾病(diabeticnephropathy,DN)是糖尿病的常见并发症,是终末期肾脏疾病的主要原因。丁酸钠(sodiumbutyrate,NaB)是一种短链脂肪酸,是肠道细菌的代谢产物,研究发现NaB可以有效缓解DN引起的肾功能和病理损伤,但具体作用及机制尚未明确。本研究通过动物模型、RNA-seq和生物信息学技术探讨NaB对DN肾组织全转录组的影响。我们成功构建DN模型小鼠的基础上,将患有DN的8周龄雄性db/db小鼠随机分为两组:DN+NaB组(按5g/kg/day对DN小鼠进行NaB腹腔注射)和DN组(等计量的生理盐水对DN小鼠进行腹腔注射)。此外,将正常的db/m小鼠用作正常对照组(NC)。对三组小鼠测量体重,肾重,血糖,尿微量白蛋白和尿肌酐等指标。通过RNA测序(RNAsequencing,RNA-Seq)进行全转录组表达情况分析。生物信息学分析DN中NaB相关的转录组分子的特征及相互关系。运用定量实时聚合酶链反应(QuantitativeReal-timepolymerasechainreactions,qRT-PCR)检测经NaB处理的肾组织和肾小球系膜细胞中相关lncRNA和mRNA的表达。本研究结果表明,DN小鼠体重、血糖、尿白蛋白与肌酐的比值、肾脏肾小球面积等均较NC组显著增高,但经NaB处理后DN小鼠尿白蛋白与肌酐的比值降低,肾小球面积增加及基底膜增厚等病理改变有所改善,血糖和体重指标未见明显改变。进一步,两组DN小鼠和对照肾脏组织RNA-Seq结果显示,DN时转录组表达发生显著变化,发现了一些lncRNA与mRNA的表达显著上调或下调,但NaB处理后部分DN异常表达lncRNA和mRNA的表达水平发生了逆转,提示其与NaB相关。我们运用qRT-PCR在高低糖培养的肾小球系膜细胞中随机验证了部分NaB相关lncRNA和mRNA,结果显示与RNA-seq结果一致。同时,生物信息学技术对NaB相关的转录组分子的深度分析结果显示,这些NaB相关的分子主要涉及免疫反应、抗原呈递与提呈等免疫相关的生物学过程,同时,这些免疫过程也广泛参与炎症的发生。通过对NaB相关lncRNA共表达网络构建发现这些lncRNA与155个关键mRNA的相互作用。通过GO及KEGG分析发现,这些lncRNA及mRNA多数涉及调节炎症的相关过程。此外,通过进一步对与炎症相关的lncRNA和mRNA构建子共表达网络,结果表明,lnc-Gm31284,lnc-Gm31278,Psme1,Psme2和Psme2b在网络中占重要地位,提示其在DN炎症反应中可能起着重要作用。综上,本研究表明NaB可改善糖尿病引起的肾脏损伤,其机制可能与影响炎症相关的转录组变化有关。
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