基于TARGET数据库对骨肉瘤的免疫浸润及免疫相关基因的研究-论文-万方医学网

基于TARGET数据库对骨肉瘤的免疫浸润及免疫相关基因的研究

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摘要目的：探索骨肉瘤微环境的免疫浸润以及免疫相关基因，筛选出与骨肉瘤患者的生存显著相关的肿瘤浸润免疫细胞以及免疫相关基因，为骨肉瘤的免疫治疗提供有生存意义的治疗靶点。<br>　　方法:本研究基于RNA测序样本，采用估计算法将85例骨肉瘤病例分为高、低评分组，采用Kaplan-Meier分析确定免疫评分与生存的关系。免疫评分组的差异表达基因(differentiallyexpressedgenes,DEGs)的mRNA表达谱采用Limma软件包和R语言进行分析。其次，利用LASSO回归分析、Kaplan-Meier分析和GEO数据库的骨肉瘤数据集进行筛选和验证与生存相关的DEGs，通过基因集富集分析对其功能进行分析。此外，通过CIBERSORT算法和线性相关分析探讨骨肉瘤微环境的免疫浸润谱与DEGs的表达水平的相关性。<br>　　结果：本研究发现骨肉瘤微环境中的免疫浸润程度与患者的生存率显著正相关，其肿瘤微环境中CD8+T细胞浸润的比例越高，患者的生存率越好。同时，基因-嗜生态型病毒整合位点2B(ecotropicvirusintegrationsite2B,EVI2B)是一个保护性免疫相关基因，其高表达不但与骨肉瘤患者良好预后呈正相关，也与CD8+T细胞的浸润程度呈正相关。<br>　　结论：EVI2B的高表达可促进CD8+T细胞在骨肉瘤微环境中的浸润程度，增加其对肿瘤细胞的杀伤能力，从而提高骨肉瘤患者的总体生存率。因此，EVI2B既可以作为一种新的预后生物标志物，也可以作为骨肉瘤治疗策略的靶点。