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摘要准确的 RNA 转录对维持细胞的生理功能至关重要，其中 RNA 聚合酶 Ⅱ （RNA polymerase Ⅱ，RNAPⅡ）对mRNA的合成至关重要。RNA 调节因子的异常会诱导恶性肿瘤细胞的状态发生改变，表明其治疗靶点仍有待探索。目前有众多与 mRNA 转录起点及调控的相关研究，且其与癌症有广泛的影响。<br>　　然而转录后调控却研究较少，尤其是在RNAPⅡ的延长及终止之间的过渡。最近有研究首次发现两个 mRNA 抗终止子。作为富含丝氨酸/精氨酸的 C 末端重复结构域（ C-terminal repeat domain，CTD）相关因子之一的 SCAF8，在癌症中普遍表达，被首次确认为mRNA的抗终止蛋白。在早期poly A位点中，SCAF4和SCAF8通过维持mRNA的延长和防止mRNA的转录片段分裂，对mRNA转录成熟起着至关重要的作用。研究表明，SCAF4或SCAF8的异常与许多疾病过程有关。已有研究发现，RNA 在癌症中受到系统调控，并有助于肿瘤的发生和进展。值得注意的是，在白血病中，一个广泛存在的内含子多聚腺苷酸化，被证明与一组肿瘤抑制因子失活有关。因此，mRNA抗终止子的功能障碍可能在癌症基因组调控中发挥重要作用，但目前仍未有相关研究。<br>　　本文通过生物信息学分析发现，SCAF8 在多种类型的癌症中表达缺失，其中在肾透明细胞癌（KIRC）中，SCAF8低表达与严重的临床病理特征和不良预后相关。结果表明，SCAF8的表达对KIRC的临床预后至关重要，由于转录终止而影响的肿瘤细胞基因组改变仍有待进一步探索。<br>　　目的:<br>　　在本研究中以 KIRC患者为对象进行生信分析，通过分析 SCAF8的表达及与 SCAF8缺失相关的基因和信号通路，旨在探讨 SCAF8在影响肾透明细胞癌预后中的作用。<br>　　方法:<br>　　（1）从TCGA数据库进行患者数据采集，利用UALCAN分析mRNA表达和基因甲基化状态。THPA数据库检测SCAF8蛋白水平。cBioPortal (cbioportal.org)用于分析SCAF8基因组改变以及SCAF8 mRNA表达与甲基化之间的相关性。<br>　　（2）采用Wilcoxon秩和检验、Logistic回归分析检验KIRC患者SCAF8表达与临床病理特征的相关性分析。<br>　　（3）采用ROC （Receiver operating characteristic, ROC）、Kaplan-Meier （K-M）生存曲线比较 KIRC 患者不同组间的总生存期（OS）、疾病特异性生存期（DSS）和无进展间隔期（PFI）。采用 Cox 回归分析以确定 SCAF8 表达作为KIRC预后的独立危险因素。采用UALCAN、cBioPortal、Metascape (metascape.org)对KIRC中与SCAF8表达相关的通路进行富集分析和关键因子筛选。<br>　　（4）采用R语言统计分析软件（3.6.3版本）及相关软件包进行数据分析和可视化。<br>　　结果：<br>　　（1）SCAF8在KIRC患者中基因和蛋白水平均低表达（P＜0.001）且与KIRC患者的临床病理学特征相关。<br>　　（2）在KIRC组织中SCAF8启动子甲基化水平明显增加，且在高临床分期患者的肿瘤组织中，甲基化水平更高，结果具有统计学差异（P＜0.001）。SCAF8启动子甲基化水平与SCAF8 mRNA表达水平呈负相关。<br>　　（3）SCAF8的表达与临床分期（T分期和N分期）、病理分期、性别和血钙水平显著相关，结果具有统计学差异（P＜0.05）。<br>　　（4）SCAF8对KIRC的诊断及不同临床亚型预后具有预测价值，SCAF8低表达患者其总生存期、疾病特异性生存期和无进展间隔期显著缩短（P＜0.05），预示着患者预后不良。<br>　　（5）SCAF8与KIRC个体发育中的关键因子VHL、SETD2及PBRM1呈高度相关，SCAF8作为RNAPⅡ的抗终止子，其缺失可能与这些基因在转录水平上的缺失有关。FABP6和MFSD2A与SCAF8表达呈负相关，提示KIRC患者预后不良。结果均具有统计学差异（P＜0.001）。<br>　　结论：<br>　　（1）SCAF8在KIRC患者中低表达，且与KIRC患者的临床特征相关。<br>　　（2）SCAF8对KIRC的诊断及不同临床亚型预后具有预测价值。<br>　　（3）SCAF8与KIRC个体发育中的关键因子高度相关，其中FABP6和MFSD2A与SCAF8表达呈负相关，FABP6和MFSD2A高表达提示KIRC患者预后不良。